本文關(guān)鍵詞：大豆再生相關(guān)基因GmRUB1的克隆及表達(dá)分析

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【摘要】：大豆再生過(guò)程涉及細(xì)胞的分裂和分化、器官的決定和形成。RUB1基因在物質(zhì)的轉(zhuǎn)移和積累以及泛素化過(guò)程等多層次、多途徑發(fā)揮著重要的調(diào)控作用。本研究利用實(shí)驗(yàn)室前期轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)得到差異表達(dá)基因GmRUB1,該基因是大豆再生中泛素化過(guò)程重要的組成部分,應(yīng)用PLACE數(shù)據(jù)庫(kù)、Interpro、expasy數(shù)據(jù)庫(kù)、SOPMA、Phyre、Protscale、MEGA5等工具對(duì)該基因的啟動(dòng)子元件、編碼氨基酸的功能、親水性、疏水性、等電點(diǎn)、二級(jí)結(jié)構(gòu)、三級(jí)結(jié)構(gòu)、同源性比較進(jìn)行分析。并研究了該基因在大豆品種東農(nóng)50各器官中的表達(dá)分析。結(jié)果表明,其前體序列具有很多與再生相關(guān)的響應(yīng)元件,理論等電點(diǎn)為7.67,脂肪系數(shù)為79.34,穩(wěn)定系數(shù)為48.06,屬于不穩(wěn)定蛋白,GmRUB1編碼的蛋白屬于泛素結(jié)合蛋白,有一個(gè)泛素化過(guò)程中的E2連接酶的結(jié)構(gòu)域,二級(jí)結(jié)構(gòu)中24.59%為α螺旋結(jié)構(gòu),39.34%為不規(guī)則卷曲,10.93%為β轉(zhuǎn)角,25.14%為延伸鏈,三級(jí)結(jié)構(gòu)共有122個(gè)氫鍵,6個(gè)螺旋結(jié)構(gòu),18個(gè)轉(zhuǎn)角結(jié)構(gòu),親水性平均系數(shù)為-0.389,GmRUB1基因與苜蓿親緣較近,qRT-PCR結(jié)果表明GmRUB1的表達(dá)量在果實(shí)中較高,說(shuō)明GmRUB1基因可能參與大豆再生過(guò)程。隨后對(duì)該基因進(jìn)行了克隆及表達(dá)載體構(gòu)建。上述結(jié)果初步分析了GmRUB1基因編碼氨基酸的生物信息學(xué)及表達(dá)情況。并通過(guò)對(duì)其進(jìn)行克隆和載體構(gòu)建,對(duì)今后進(jìn)一步研究該基因的功能,提高大豆再生率,建立穩(wěn)定的大豆再生體系提供了理論基礎(chǔ)。
【作者單位】： 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院大豆生物學(xué)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;65301部隊(duì)農(nóng)副業(yè)基地;
【關(guān)鍵詞】： GmRUB 克隆 大豆 再生 生物信息學(xué)
【基金】：黑龍江省杰出青年基金(JJ2016JQ0029) 哈爾濱市優(yōu)秀學(xué)科帶頭人項(xiàng)目(2015RQXXJ018) 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)大學(xué)生SIPT項(xiàng)目共同資助
【分類(lèi)號(hào)】：S565.1;Q943.2
【正文快照】： *通訊作者,xxwu2012@126.comCloning and Expression Analysis of Regeneration Related Gene Gm RUB1in SoybeanYu Yicheng1Pan Xiaocheng2Xu Mengjie1Zhang Hechun1Wang Lingdong1Wei Yi1Wu Xiaoxia1*1 Key Laboratory of Soybean Biology in Chinese Ministry of Education，

本文編號(hào)：920516