水稻糯性相關(guān)基因的全基因組關(guān)聯(lián)分析
發(fā)布時(shí)間:2017-09-23 08:10
本文關(guān)鍵詞:水稻糯性相關(guān)基因的全基因組關(guān)聯(lián)分析
更多相關(guān)文章: 水稻 全基因組關(guān)聯(lián)分析 糯性 候選基因
【摘要】:利用1 090 071個(gè)SNP標(biāo)記,對(duì)419份廣西地方稻種資源核心種質(zhì)的糯性進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析。結(jié)果表明,運(yùn)用混合線性模型,在P4.72×10~( 8)(4.72E 8)水平下,檢測(cè)到45個(gè)與糯性顯著關(guān)聯(lián)的SNP位點(diǎn),均位于第6號(hào)染色體上。通過(guò)篩選顯著關(guān)聯(lián)位點(diǎn)上、下游各150 kb區(qū)域內(nèi)的基因,共找到305個(gè)候選基因,其中包含2個(gè)與淀粉合成酶相關(guān)的Wx和SSIIa基因;同時(shí)在第6號(hào)染色體5.69 5.89 Mb區(qū)域發(fā)現(xiàn)4個(gè)與糯性顯著關(guān)聯(lián)的SNP位點(diǎn),該區(qū)域可能是影響水稻(Oryza sativa)糯性的重要候選區(qū)域。
【作者單位】: 廣西農(nóng)業(yè)科學(xué)院水稻研究所;廣西水稻遺傳育種重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;廣西農(nóng)業(yè)科學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】: 水稻 全基因組關(guān)聯(lián)分析 糯性 候選基因
【正文快照】: 楊行海,農(nóng)保選,夏秀忠,張宗瓊,曾宇,劉開強(qiáng),鄧國(guó)富,李丹婷(2016).水稻糯性相關(guān)基因的全基因組關(guān)聯(lián)分析.植物學(xué)報(bào)51,737 742.水稻(Oryza sativa)是世界上最重要的糧食作物之一,全世界超過(guò)一半人口以稻米為主食。隨著生產(chǎn)的發(fā)展和人民生活水平的提高,人們對(duì)稻米的品質(zhì)提出了更
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,本文編號(hào):904139
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