本文關(guān)鍵詞：玉米大斑病菌GPCRs超家族的基因鑒定及其在孢子發(fā)育過程中的轉(zhuǎn)錄模式

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【摘要】：G蛋白偶聯(lián)受體(G protein-coupled receptors,GPCRs)廣泛存在于動物、植物以及微生物中,是最大的涉及信號轉(zhuǎn)導(dǎo)的膜受體家族。本研究通過基于隱馬爾科夫模型的HMMER 3.0軟件搜索玉米大斑病菌(Setosphaeria turcica)基因組數(shù)據(jù)庫,鑒定并獲得GPCRs超家族基因及其基因組定位;采用MEGA 6.0軟件進行系統(tǒng)進化分析;通過通用樣品數(shù)據(jù)系統(tǒng)(generalized sample data system,GSDS)工具進行基因結(jié)構(gòu)分析;利用Inter Pro和SMART工具分析GPCRs的保守結(jié)構(gòu)域。進一步利用q RT-PCR技術(shù),對所確定的GPCR基因在分生孢子發(fā)育形成侵染結(jié)構(gòu)的過程中不同階段的相對表達量進行分析。結(jié)果表明,在玉米大斑病菌基因組中至少有9個典型的GPCR,其中3個屬氮源感應(yīng)因子類,信息素受體和碳源感應(yīng)因子類各2個,類環(huán)磷酸腺苷受體和真菌視蛋白類各1個。這些基因散布在玉米大斑病菌基因組中,且結(jié)構(gòu)復(fù)雜多樣,但所有成員編碼產(chǎn)物均由N端、7個跨膜結(jié)構(gòu)域、3個胞內(nèi)環(huán)、3個胞外環(huán)及C端組成。每個跨膜結(jié)構(gòu)域包含20~25個氨基酸。以分生孢子為對照,所有基因在附著胞成熟時期接種后12 h(12 hours post inoculation,12 hpi)均顯著下調(diào)(P0.05);除基因St Rtc1和Stfdd123以外,全部基因整體變化趨勢均呈現(xiàn)上調(diào)/持平(3 hpi)-上調(diào)(6 hpi)-下調(diào)(12 hpi)-上調(diào)(24 hpi)的規(guī)律,尤其在侵入絲形成時期(24 hpi)顯著上調(diào)(P0.05)。在附著胞形成時期(6 hpi),僅St Ste2p和St Rtc2表達顯著上調(diào)。St Rtc1和Stfdd123在各階段中的表達量與對照差異不顯著或顯著降低。本研究為深入解析植物病原真菌GPCR超家族的功能提供了理論依據(jù)。
【作者單位】： 河北農(nóng)業(yè)大學生命科學學院/河北省植物生理與分子病理學重點實驗室;河北省農(nóng)林科學院谷子研究所;
【關(guān)鍵詞】： 玉米大斑病菌 G蛋白偶聯(lián)受體 侵染 轉(zhuǎn)錄模式
【基金】：國家自然科學基金項目(No.31301616) 河北省高等學校青年拔尖人才計劃項目(No.BJ2014349Y) 河北省自然科學基金項目(No.C2014204111;No.C2016204160)
【分類號】：S435.131.4
【正文快照】： *同等貢獻作者G蛋白偶聯(lián)受體(G protein coupled receptors,GPCRs)是拓撲構(gòu)象為7次跨膜的受體(王迪等,2012),作為最大的膜受體家族,是令世人矚目的藥物靶標之一(趙玉華,2002)。GPCR通過與G蛋白偶聯(lián)參與信號轉(zhuǎn)導(dǎo)過程,能夠調(diào)節(jié)感官感應(yīng)、趨化性、神經(jīng)傳遞、細胞交流、感光、嗅覺

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本文編號：900408