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藥用野生稻葉中花色苷合成基因的序列特點與表達(dá)差異

發(fā)布時間:2017-09-14 23:07

  本文關(guān)鍵詞:藥用野生稻葉中花色苷合成基因的序列特點與表達(dá)差異


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【摘要】:為全面把握花色苷合成基因在非模式植物綠色組織中的構(gòu)成和表達(dá),本研究利用轉(zhuǎn)錄組重測序方法,對藥用野生稻(Oryza officinalis)綠葉中出現(xiàn)的花色苷合成基因進(jìn)行了分析,結(jié)果共鑒定出8個相關(guān)基因(CHS、CHI、F3H、F3′H、F3′5′H、DFR、ANS和UFGT),這些基因與栽培稻同源基因?qū)χg在mRNA水平上的序列相似度達(dá)到了94%~96%。相對外類群的K_a/K_s(非同義替換率與同義替換率的比值)統(tǒng)計檢驗進(jìn)一步表明這8個基因均處于嚴(yán)格的純化選擇之下。RPKM(每百萬讀段中每千個堿基長度的讀段數(shù))值分析表明,8個基因的表達(dá)水平不同,其中F3′5′H的相對表達(dá)量最高,CHI和CHS次之,F3′H最低。
【作者單位】: 曲阜師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】藥用野生稻 葉轉(zhuǎn)錄組 花色苷合成途徑 基因表達(dá)
【基金】:國家自然科學(xué)基金(31570218)~~
【分類號】:S511.9
【正文快照】: 收稿2016-05-10修定2016-07-21資助國家自然科學(xué)基金(31570218)。花色苷是一類水溶性植物色素,屬于類黃酮(flavonoids)的一個亞類,是具有類黃酮典型結(jié)構(gòu)——2-苯基苯丙吡喃陽離子結(jié)構(gòu)的衍生物,具有C6-C3-C6碳骨架;ㄉ諒V泛分布于植物的花、果實、莖、葉和根等器官中,是植物

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1 程在全,黃興奇,錢君,張義正,吳成軍,王丹青,唐志敏,王玲仙,周英;珍稀瀕危植物——云南藥用野生稻自然生態(tài)群的新發(fā)現(xiàn)及其特性[J];云南植物研究;2004年03期

2 張歡歡;劉蕊;郭海濱;李亞娟;;藥用野生稻有利基因發(fā)掘與利用研究進(jìn)展[J];中國農(nóng)學(xué)通報;2009年19期

3 秦學(xué)毅,韋素美,武波,黃鳳寬,覃祖芳;藥用野生稻抗源對褐稻虱的抗性遺傳及利用研究[J];西南農(nóng)業(yè)學(xué)報;2002年04期

4 陳成斌,黃娟,徐志健,梁世春;廣西藥用野生稻遺傳多樣性的分子評價[J];中國農(nóng)學(xué)通報;2002年03期

5 秦學(xué)毅,朱汝財,韋素美,武波,黃鳳寬,李道遠(yuǎn),唐建淮;藥用野生稻抗稻褐飛虱鑒定與利用技術(shù)研究[J];中國水稻科學(xué);2004年06期

6 楊士杰;藥用野生稻雜交后代對稻縱卷葉螟的抗性[J];安徽農(nóng)業(yè)科學(xué);2005年04期

7 高露;王德彬;劉新瓊;覃瑞;;栽培稻、斑點野生稻、藥用野生稻基因組比較分析[J];湖北農(nóng)業(yè)科學(xué);2007年04期

8 師翱翔,羅善昱,黃輝曄,韋素美,吳妙q,

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