本文關(guān)鍵詞：水稻Ra基因的分子標記開發(fā)及應用

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【摘要】：本研究通過對黑米(豫南黑秈糯)和紫葉白米(IR1552)Ra基因的測序,共找到了3個序列多態(tài)性位點。黑米的第10外顯子存在2 bp缺失,紫葉白米的第2外顯子(5'-UTR區(qū))存在8 bp缺失,紫葉白米的第6內(nèi)含子存在30 bp缺失。根據(jù)這3個多態(tài)性位點,分別設(shè)計了3對共顯性分子標記Ra Marker1、Ra Marker2和Ra Marker3。將它們分別應用于黑米和白米重組自交系的篩選和驗證,發(fā)現(xiàn)黑米的Ra基因型表現(xiàn)為Ra/Ra,白米的基因型表現(xiàn)為ra/ra,褐米的基因型表現(xiàn)為Ra/Ra或ra/ra。再加上該基因和黑米色素調(diào)控基因緊密連鎖,因此這3個分子標記是黑色種皮的可靠標記,可進一步用于分子標記輔助育種的實踐中。通過對Ra表達情況分析,發(fā)現(xiàn)該基因的2 bp缺失僅存在于黑米和褐米的c DNA中。通過實時定量PCR研究,發(fā)現(xiàn)該基因在黑米和褐米中存在一定的時空表達差異性。
【作者單位】： 中國水稻研究所;浙江大學農(nóng)業(yè)與生物技術(shù)學院;浙江省微生物研究所;
【關(guān)鍵詞】： 水稻 黑米 分子標記 基因連鎖 時空表達
【基金】：國家自然科學基金(31500246) 中央級公益性科研院所基本科研業(yè)務(wù)費專項(2014RG006-1) 浙江省科技廳科研院所專項(2016F50015)共同資助
【分類號】：S511
【正文快照】： The Exploitation and Application of Molecular Markers of Ra In RiceShao Yafang1,3*Liu Chengzhi2Bao Jinsong31 China National Rice Research Institute,Hangzhou,310006;2 Zhejiang Institute of Microbiology,Hangzhou,310000;3 College of AgricultureBiotechnolog

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