本文關(guān)鍵詞：基于目標(biāo)基因芯片數(shù)據(jù)預(yù)測(cè)lncRNAs調(diào)控腦缺血再灌注損傷后的作用效應(yīng)

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【摘要】：長(zhǎng)鏈非編碼RNAs(long noncoding RNAs,lncRNAs)在細(xì)胞中有重要調(diào)控作用。已有研究報(bào)道,腦缺血再灌注損傷可誘導(dǎo)大量lncRNAs表達(dá)水平的改變,然而其具體作用機(jī)理未知�，F(xiàn)從GEO數(shù)據(jù)庫(kù)中下載基因芯片數(shù)據(jù),分析損傷后腦組織中l(wèi)ncRNAs和mRNAs的表達(dá)改變。結(jié)果顯示27條lncRNAs和408條mRNAs表達(dá)上調(diào),9條lncRNAs和31條mRNAs表達(dá)下調(diào)。同時(shí),基因本體論和通路富集分析顯示差異表達(dá)的轉(zhuǎn)錄本在免疫和炎癥反應(yīng)、細(xì)胞凋亡調(diào)控等生物過(guò)程及相關(guān)通路顯著富集。此外,基于lncRNAs目標(biāo)預(yù)測(cè)程序和lncRNAs-mRNAs共調(diào)控網(wǎng)絡(luò),對(duì)序列數(shù)據(jù)和表達(dá)數(shù)據(jù)進(jìn)行綜合分析,發(fā)現(xiàn)差異表達(dá)lncRNAs參與調(diào)控細(xì)胞凋亡、免疫和炎癥反應(yīng),并推測(cè)出linc RNA(chr1 9:5771 425-5848475_F)、lincRNA(chr1:1 37503023-1 37625604_R)和lincRNA(chr1 4:21 029450-21 049451_F)等lncRNAs潛在的靶基因和調(diào)控機(jī)制。這些發(fā)現(xiàn)提示lncRNAs廣泛參與調(diào)控腦缺血再灌注損傷,為缺血性腦卒中損傷機(jī)制和治療方案提供新的研究方向。
【作者單位】： 南京醫(yī)科大學(xué)第一臨床醫(yī)學(xué)院;南京醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】： 腦缺血 長(zhǎng)鏈非編碼RNA 免疫反應(yīng) 炎癥反應(yīng) 生物信息學(xué)預(yù)測(cè) 基因芯片數(shù)據(jù) GEO數(shù)據(jù)庫(kù)
【基金】：國(guó)家大學(xué)生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)訓(xùn)練計(jì)劃項(xiàng)目(201310312015Z)
【分類號(hào)】：R743.3
【正文快照】： 腦卒中是威脅人類健康的重大疾病之一。根據(jù)病因,腦卒中可分為缺血性和出血性兩種類型,其中缺血性腦卒中約占腦卒中病人總數(shù)的60%~80%。缺血性腦卒中開始于大腦動(dòng)脈的堵塞,缺血區(qū)在低氧低糖的情況下能量代謝發(fā)生改變,導(dǎo)致細(xì)胞離子平衡紊亂、酸中毒、炎癥反應(yīng)等一系列事件的發(fā)，

本文編號(hào)：816521