本文關鍵詞：金針菇單核體DAN3和M與其雜交雙核體G1菌絲階段基因表達差異的轉錄組初步分析

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【摘要】：以金針菇(Flammulinavelutipes)單核菌株DAN3的基因組為參考,完成單核體DAN3和M及其雜交雙核體G1在菌絲階段的轉錄組測序與數(shù)據(jù)分析,比較兩個樣本間的差異基因,并對差異基因進行GO功能分析和KEGG pathway分析。結果表明:兩個樣本中共有顯著性差異表達的基因86個,其中,在G1中呈上調、下調表達的基因數(shù)分別為41、45個,有2個基因在G1中特異表達。GO功能分析結果表明,86個差異基因中有40個基因比對上了GO功能注釋,其中18個基因在G1中呈上調表達;單一生物過程和催化活性為顯著性富集的功能,相關基因在G1中呈上調表達。KEGG pathway分析結果表明,22個差異基因被定位到17條Pathway,其中10個基因在G1中呈上調表達,包括賴氨酸代謝途徑對應基因,3_M和G1菌絲樣品中賴氨酸含量分別為1.70×103 ng/mg和1.06×103 ng/mg,說明G1中上調的基因可能與之降解相關;DNA復制是顯著性富集的代謝途徑,相關基因在G1中呈下調表達。
【作者單位】： 上海海洋大學食品學院;上海市農業(yè)科學院食用菌研究所農業(yè)部南方食用菌資源利用重點實驗室國家食用菌工程技術研究中心國家食用菌加工技術研發(fā)中心上海市農業(yè)遺傳育種重點開放實驗室;
【關鍵詞】： 菌絲 轉錄組 差異表達基因 GO功能分析 KEGG pathway分析
【基金】：國家科技支撐項目(2013BAD16802)資助
【分類號】：S646.15
【正文快照】： 金針菇(Flammulinavelutipes(Fr.)Sing),是著名的食、藥兩用真菌,不僅味道鮮美,且含有多種對人體有益的成分[1],為我國產量最高的工廠化生產菇種。作為典型的四極異宗結合的真菌[2],金針菇雙核菌絲的形成由兩對交配型因子A、B控制[3]。A、B因子都不同的單核菌絲質配,形成具有

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本文編號：792693