本文關鍵詞：谷子CO家族基因的全基因組鑒定與分析

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【摘要】：抽穗開花是高等植物從營養(yǎng)生長向生殖生長轉變的過程,該過程受到眾多基因的調控。CONSTANS(CO)是光周期開花途徑中的一個關鍵基因,是生物節(jié)律鐘基因和開花基因之間的關鍵樞紐。利用生物信息學的方法,從谷子基因組中鑒定了34個CO基因;與擬南芥CO家族的17個成員進行同源比對,發(fā)現Seita.7G007800與Seita.9G020100相似性最高;在此基礎上,分析了谷子CO基因的啟動子,發(fā)現啟動子有光響應元件Sp1、脫落酸響應元件ABRE以及赤霉素響應元件P-box等;RNA-Seq轉錄組測序發(fā)現,這些CO基因在葉片中表達量存在顯著差異,其中,Seita.4G192300基因表達量最高,而Seita.1G304900,Seita.3G080700和Seita.4G001600這3個基因在葉片中不表達。這些結果不僅為深入研究CO基因與抽穗開花的關系提供依據,而且為后續(xù)谷子抽穗開花途徑的研究奠定理論基礎。
【作者單位】： 山西農業(yè)大學文理學院;山西農業(yè)大學研究生院;山西農業(yè)大學生命科學學院;
【關鍵詞】： 谷子 全基因組 CONSTANS 光周期途徑 抽穗 開花
【基金】：山西省回國留學人員科研資助項目(2015-067) 山西省留學回國人員科技活動擇優(yōu)資助項目(2014-11)
【分類號】：S515
【正文快照】： 谷子(Setaria italica)是禾本科狗尾草屬植物,具有抗旱性強、耐貧瘠等優(yōu)點,廣泛種植于干旱和半干旱地區(qū)。2012年,由美國國家能源部所屬的聯合基因組研究所和中國華大基因分別進行的豫谷1號和張谷的全基因組測序工作相繼完成,從此谷子功能基因組學研究進入了一個新的時代[1-2]

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本文編號：763980