本文關(guān)鍵詞：西洋梨水孔蛋白基因家族的全基因組鑒定及表達(dá)分析

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【摘要】：水孔蛋白(AQPs,aquaporins)是高效轉(zhuǎn)運水分子的膜內(nèi)在蛋白,具有豐富的多樣性,在調(diào)控植物的水分關(guān)系中有重要作用。本研究利用西洋梨(Pyrus communis L.‘Bartlett’)基因組數(shù)據(jù)庫,通過生物信息學(xué)手段鑒定西洋梨PcAQPs基因家族成員;并利用MEGA 6.0.5軟件,采用鄰接法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹;利用GSDS 2.0軟件進(jìn)行基因結(jié)構(gòu)分析,MEME程序進(jìn)行Motif分析,AgBase v2.00程序進(jìn)行GO分析;采用半定量RT-PCR技術(shù)研究PcAQPs基因組織表達(dá)情況。結(jié)果表明,西洋梨基因組中共有54個PcAQPs家族成員,均含有AQP特征結(jié)構(gòu)域和保守的Motif基序,根據(jù)基因結(jié)構(gòu)及系統(tǒng)進(jìn)化分析可分為PIP、TIP、NIP和SIP等4個亞家族。不同基因間結(jié)構(gòu)差別較大,但聚類關(guān)系較近的基因其結(jié)構(gòu)類似。GO分析發(fā)現(xiàn),多數(shù)PcAQPs基因具有轉(zhuǎn)運蛋白活性,參與物質(zhì)轉(zhuǎn)運、應(yīng)激反應(yīng)、發(fā)育和代謝等生物學(xué)過程,但不同亞家族成員構(gòu)成的細(xì)胞組分及參與的生物學(xué)過程具有明顯差異。半定量結(jié)果表明,大多數(shù)PcAQPs基因在根、莖、葉和果實中均有表達(dá),而且不同基因家族、不同基因間的組織表達(dá)模式存在差異。該研究為今后西洋梨PcAQPs基因的克隆和功能分析奠定了基礎(chǔ)。
【作者單位】： 山東省果樹研究所;
【關(guān)鍵詞】： 西洋梨 水孔蛋白 全基因組分析 表達(dá)分析
【基金】：山東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院青年科研基金(2015YQN41) 山東省良種工程項目(梨優(yōu)質(zhì)矮化、多抗功能基因挖掘與種質(zhì)創(chuàng)新利用2014) 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)(梨)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系(CARS-29) “十二五”農(nóng)村領(lǐng)域國家科技計劃(2014BAD16B034) 山東省自然科學(xué)基金(ZR2015YL075)
【分類號】：S661.2
【正文快照】： URL:http://www.cnki.net/kcms/detail/11.4996.S.20160128.1520.010.html跨膜運輸途徑,即水分跨過液泡膜和質(zhì)膜的運輸途徑,是水分在植物組織內(nèi)運輸?shù)闹饕绞街�。水分跨膜運輸以兩種方式進(jìn)行:通過脂雙層的自由擴(kuò)散運輸和水孔蛋白的跨膜運輸[1]。水孔蛋白,又稱水通道蛋白(AQ

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