本文關鍵詞：甘蔗ScHTD2基因的克隆及生物信息學分析

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【摘要】：D14是一類能夠有效抑制水稻分蘗的水解酯酶,可能是獨腳金內(nèi)酯信號傳導途徑中的重要組分。為研究該基因在甘蔗分蘗性狀中的功能,利用RT-PCR和RACE技術(shù)從甘蔗主栽品種ROC22中克隆出D14同源基因的c DNA全長,命名為Sc HTD2,并對其進行生物信息學分析。結(jié)果表明:Sc HTD2基因的c DNA全長為1 302 bp(KP137674.1),具有927 bp的開放閱讀框,編碼308個氨基酸;蛋白質(zhì)分析表明,Sc HTD2為不穩(wěn)定的水溶性非分泌蛋白,主要作用于氨基酸的生物合成或者作為生長因子調(diào)控生物生長發(fā)育。亞細胞定位于葉綠體,存在14個磷酸化位點,不存在乙酰化位點和信號肽。二級結(jié)構(gòu)以α螺旋和無規(guī)則卷曲為主,還有一些殘基形成β-折疊和鏈延伸。保守結(jié)構(gòu)域和三級結(jié)構(gòu)預測均表明該蛋白包含一個α保守水解酶家族,屬"D14-Like"或者"DAD2-Like"蛋白家族。推測Sc HTD2可能作為獨腳金內(nèi)酯調(diào)控甘蔗分蘗信號轉(zhuǎn)導中一個具有催化特性的水解脂酶而起作用。進化樹分析表明該蛋白與高粱、玉米等單子葉植物進化關系較近。
【作者單位】： 云南農(nóng)業(yè)大學農(nóng)學與生物技術(shù)學院;云南省農(nóng)業(yè)科學院甘蔗研究所云南省甘蔗遺傳改良重點實驗室;
【關鍵詞】： 甘蔗 獨腳金內(nèi)酯 ScHTD 克隆 生物信息學分析
【基金】：國家自然科學基金(No.31360359) 云南省中青年學術(shù)技術(shù)帶頭人后備人才(No.2014HB038) 云南省應用基礎研究計劃青年項目(No.2015FD063)
【分類號】：S566.1
【正文快照】： 中國食糖生產(chǎn)主要依靠甘蔗和甜菜作為原料,其中甘蔗糖占據(jù)了整個食糖產(chǎn)量的90%以上。甘蔗品種以有效莖作為收獲產(chǎn)品,有效莖粗大而多是高產(chǎn)的重要指標,而大莖高產(chǎn)的關鍵則是在其分蘗期控制好分蘗芽的萌發(fā)[1]。分蘗芽的萌發(fā),受多種因素控制,如環(huán)境、水肥、生長階段,內(nèi)部調(diào)控因子

【參考文獻】

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中國博士學位論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條

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【共引文獻】

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2 呂愛麗;李旭娟;劉洪博;吳才文;曾千春;劉新龍;;甘蔗ScHTD2基因的克隆及生物信息學分析[J];熱帶作物學報;2016年06期

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本文編號：734873