發(fā)布時間：2017-08-24 21:46

  本文關(guān)鍵詞：miR-550a-5p在骨髓增生異常綜合征中的表達及其靶基因預(yù)測

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【摘要】：目的:探討miR-550a-5p在骨髓增生異常綜合征(MDS)患者骨髓中的表達情況并通過生物信息學(xué)分析預(yù)測靶基因及其功能,為進一步研究miR-550a-5p及其靶基因在MDS發(fā)病機制中的作用提供依據(jù)。方法:采用realtime PCR技術(shù)檢測miR-550a-5p在54例MDS患者、16例MDS轉(zhuǎn)化白血病患者及19例健康對照中的表達量,并分析其與臨床病理特征(包括染色體情況、骨髓原始細胞比例及外周血血象)的相關(guān)性。應(yīng)用miRBase獲得并分析多個物種miR-550的序列特征;應(yīng)用Microcosm、Miranda和Targetscan預(yù)測miR-550a-5p的靶基因,并取預(yù)測結(jié)果交集,進一步進行基因功能的GO(富集)分析和信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路(Pathway)的富集分析。結(jié)果:miR-550a-5p表達量在所有MDS患者骨髓中均比對照組升高:在低危+中危1組中表達量是對照組的1.7倍(P=1.23×10-10);在中危2+高危組中表達量是對照組的1.9倍(P=1.20×10~(-10));在MDS轉(zhuǎn)化為白血病組中的表達量是對照組的2.0倍(P=5.61×10~(-10))。隨著MDS疾病危險度增高,miR-550a-5p表達水平逐漸上升,但其表達量與MDS患者的臨床病理特征(包括染色體情況、骨髓原始細胞比例及外周血血象)之間無明顯相關(guān)。利用生物信息學(xué)預(yù)測miR-550a-5p在MDS中的靶基因,結(jié)合文獻報道選出了其中2個可能與miR-550a-5p調(diào)控MDS發(fā)生發(fā)展的病理機制有關(guān)的靶基因——PDLIM2和PSME1。結(jié)論:miR-550a-5p在MDS患者骨髓細胞中呈現(xiàn)出特異性高表達,推測其可能通過調(diào)控靶基因PDLIM2和PSME1參與MDS病理生理過程。
【作者單位】： 廣西醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院血液科;
【關(guān)鍵詞】： miR-a-p 骨髓增生異常綜合征 靶基因
【基金】：國家自然科學(xué)基金項目(81160072);國家自然科學(xué)基金項目(81560028)
【分類號】：R551.3
【正文快照】： M DS(chromosome:Normal:1.11±0.19,Abnormal:1.26±0.15,P0.05;Percentage of M arrow Blasts:r=0.29,P=0.07;absolute neutrophil count:r=-0.02,P=0.89;hemoglobin level:r=0.09,P=0.57;platelet count:r=0.25,P=0.08).The sequence of miR-550 w as conservative among ，

本文編號：733308