GyrB基因在諾卡菌菌種鑒定中的應用研究
發(fā)布時間:2017-08-22 16:35
本文關鍵詞:GyrB基因在諾卡菌菌種鑒定中的應用研究
【摘要】:目的分析研究gyr B基因對于諾卡菌種水平的鑒定能力。方法采用特異性引物對14種41株諾卡菌的gyr B基因進行擴增,并對其產(chǎn)物進行測序。從Gen Bank數(shù)據(jù)庫中下載21株諾卡菌gyr B基因序列,對序列用DNAStar軟件計算其相似性。利用Mega 6.06軟件,采用鄰接法和最大似然法構建諾卡菌菌種系統(tǒng)發(fā)育進化樹。結果以gyr B基因構建的系統(tǒng)發(fā)育進化樹中,不同諾卡菌種能準確地分離成獨立的分支,且親緣關系較近的近緣種也能得到有效分離。諾卡菌種gyr B基因種內(nèi)相似性為94.2%~100%,種間相似性約為79.2%~97.6%,平均相似性為86.9%。結論 gyr B基因序列分析是一種快速、準確、特異性較高的鑒定方法,能將諾卡菌屬的鑒定至種的水平,對于鑒定諾卡菌屬近緣種gyr B基因比16S r DNA更具優(yōu)越性。
【作者單位】: 溫州醫(yī)科大學檢驗醫(yī)學院 檢驗醫(yī)學教育部重點實驗室;中國疾病預防控制中心傳染病預防控制所傳染病預防控制國家重點實驗室;
【關鍵詞】: 諾卡菌 gyrB基因 鑒定
【基金】:國家高技術研究發(fā)展計劃(863計劃)(No.2014AA021404)~~
【分類號】:R440
【正文快照】: 作者單位:1.溫州醫(yī)科大學檢驗醫(yī)學院,檢驗醫(yī)學教育部重點實驗室,溫州325035;2.中國疾病預防控制中心傳染病預防控制所,傳染病預防控制國家重點實驗室,北京102206Corresponding author:LOU Yong-liang,Email:louyongliang2013@163.com諾卡菌(Nocardia,N.),屬于諾卡菌種,是一種
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,本文編號:720214
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