發(fā)布時間：2017-08-06 09:25

  本文關鍵詞：秈稻低親和陽離子轉運蛋白基因OsLCT2的克隆與生物信息學分析

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【摘要】：OsLCT1是目前在水稻中唯一鑒定出來的參與韌皮部鎘離子運輸?shù)年P鍵轉運蛋白,與水稻籽粒鎘積累密切相關。本研究根據(jù)Gene Bank已發(fā)表的小麥Ta LCT1基因序列信息設計引物,利用RT-PCR方法從秈稻93-11和華占中克隆了低親和陽離子轉運蛋白基因(LCT),并命名為OsLCT2。生物信息學分析結果表明,該基因定位在5號染色體上,全長2 699 bp,包含3個外顯子和2個內(nèi)含子,其CDS全長1 437 bp,編碼478個氨基酸,包含2個PEST序列和11個跨膜結構域。OsLCT2蛋白二級結構預測顯示,α-螺旋占57.11%、β-折疊占7.74%,無規(guī)則卷曲占35.15%。序列比對和系統(tǒng)進化樹分析結果表明,OsLCT2與小麥的親緣關系最近達65%,其次為高粱64%,而與水稻OsLCT1的同源性并不高,推測OsLCT2的功能可能與Ta LCT1相類似。
【作者單位】： 湖南農(nóng)業(yè)大學生物科學技術學院;湖南雜交水稻研究中心雜交水稻國家重點實驗室;
【關鍵詞】： 水稻 鎘 低親和陽離子轉運蛋白 OsLCT
【基金】：湖南省自然科學基金項目(14JJ7084) 湖南省重大科研攻關項目(湘財農(nóng)指(2014)180號)共同資助
【分類號】：S511.21
【正文快照】： *通訊作者,brzhao652@hhrrc.ac.cn;pkq8055@hunau.netCloning and Bioinformatics Analysis of Low-affinity Cation TransporterGene Os LCT2 in Indica Rice(Oryza sativa)Li Yaokui1,2Tang Li2Mao Bigang2Zhao Bingran2*Peng Keqin1*1 College of Bioscience and Biotechno，

本文編號：629292