本文關(guān)鍵詞：miR-223基因家族的分子進(jìn)化與靶基因預(yù)測(cè)，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：目的:分析所有miR-223基因家族成員的序列特征,并對(duì)miR-223靶基因進(jìn)行預(yù)測(cè),然后分析miR-223靶基因的生物學(xué)功能。方法:利用Clustal X 1.83軟件分析miR-223基因序列特征,MEGA 5.0軟件分析進(jìn)化關(guān)系,再運(yùn)用TargetScan、PicTar和miRDB進(jìn)行靶基因預(yù)測(cè),最后GO和KEGG進(jìn)行功能分析。結(jié)果:在miRBase數(shù)據(jù)中獲得miRNA-223基因家族成員的序列27條,絕大部分位于基因間隔區(qū),少數(shù)成員的基因位置未知。大部分定位于X染色體,部分成員位于常染色體。miRNA-223成熟序列長(zhǎng)度在20-23nt之間,同源性較高。系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析表明,miRNA-223基因家族成員分為三支。預(yù)測(cè)獲得人類(lèi)miRNA-223的可能具有27個(gè)靶基因,它們主要與信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、轉(zhuǎn)錄調(diào)控以及細(xì)胞生長(zhǎng)發(fā)育等密切相關(guān)。結(jié)論:本研究結(jié)果不僅有利于理解miR-223基因家族的生物學(xué)功能,也可為后續(xù)研究提供理論依據(jù)。
【作者單位】： 川北醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院檢驗(yàn)科;川北醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院醫(yī)學(xué)研究中心;川北醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院風(fēng)濕免疫科;
【關(guān)鍵詞】： miRNA- 分子進(jìn)化 靶基因 功能分析
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金(81272047) 四川省教育廳科研項(xiàng)目(15ZB0197) 南充市科技支撐項(xiàng)目(14A0061) 川北醫(yī)學(xué)院科研發(fā)展計(jì)劃博士科研啟動(dòng)基金(CBY14-QD-07,CBY13-QD-03)
【分類(lèi)號(hào)】：R3416
【正文快照】： miRNAs是一類(lèi)大小約20~25個(gè)核苷酸的內(nèi)源性非編碼小分子,廣泛存在于病毒,植物,人類(lèi)等真核生物[1]。早在1993年,Lee等[2]從線蟲(chóng)中發(fā)現(xiàn)了第一個(gè)小RNA—lin-4。之后,Reinhart等[3]發(fā)現(xiàn)了第二個(gè)小RNA—let-7,它們參與線蟲(chóng)發(fā)育的時(shí)序調(diào)控。2001年,三個(gè)不同的研究小組同時(shí)鑒定了多個(gè)

【相似文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：470975