基于SVM的腫瘤特征基因提取與基因表達(dá)數(shù)據(jù)分析
發(fā)布時(shí)間:2017-06-15 19:10
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【摘要】:提出一種基于支持向量機(jī)的腫瘤基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)挖掘方法。首先采用信噪比方法對白血病、結(jié)腸癌、肺癌數(shù)據(jù)提取特征基因,生成特征基因子集。然后通過支持向量機(jī)分類模型對特征基因子集進(jìn)行機(jī)器學(xué)習(xí)訓(xùn)練分類。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明:急性白血病、結(jié)腸癌只需4個(gè)特征基因,均獲得100%的10折交叉驗(yàn)證分類準(zhǔn)確率。最后為了有效地排除噪聲基因進(jìn)而挑選出精確度更高的分類特征基因,采用多尺度小波閾值法對肺癌數(shù)據(jù)進(jìn)行降噪處理,降噪后僅需5個(gè)特征基因獲得96.61%的分類準(zhǔn)確率。
【作者單位】: 青島職業(yè)技術(shù)學(xué)院生物與化工學(xué)院;青島科技大學(xué)數(shù)理學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】: 基因表達(dá)譜 腫瘤分類 特征基因 信噪比 支持向量機(jī)
【基金】:國家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(41204115) 山東省自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(ZR2013AM007,ZR2014FL021) 山東省高等學(xué)?萍加(jì)劃項(xiàng)目(J13LI54)
【分類號】:TP18;R730.2
【正文快照】: 引用格式:譚云,于彬,王琦然,等.基于SVM的腫瘤特征基因提取與基因表達(dá)數(shù)據(jù)分析[J].重慶理工大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)),2016(6):102-108.Citation format:TAN Yun,YU Bin,WANG Qi-ran,et al.Extraction of Cancer Informative Genes and Gene Expression DataAnalysis Based on Suppo
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1 孫德利,舒琦瑾;基因表達(dá)譜在中醫(yī)藥研究中的意義[J];中國中醫(yī)藥信息雜志;2002年01期
2 劉s
本文編號:453266
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