發(fā)布時間：2017-06-04 09:18

  本文關(guān)鍵詞：miR-320在骨髓增生異常綜合征中的表達(dá)分析及其靶基因預(yù)測，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：1、研究目的為了探究mi R-320在骨髓增生異常綜合征(Myelodysplastic syndrome,MDS)中可能的作用機制,本研究擬以前期利用micro RNA芯片技術(shù)在MDS患者中篩選出的特異性micro RNA為基礎(chǔ),篩選出具有顯著表達(dá)差異的mi R-320進行其表達(dá)水平的檢測。由于mi R-320a在腫瘤表達(dá)中更為常見,具有研究意義,利用生物信息學(xué)預(yù)測其直接靶基因,并進行GO分析及Pathway分析了解潛在的作用通路,為MDS患者的診斷和治療提供新的理論基礎(chǔ)。2、研究方法在前期研究的micro RNA芯片檢測結(jié)果中篩選出具有表達(dá)差異的mi R-320等7個具有表達(dá)差異的基因。利用Real-time PCR檢測技術(shù)在10例MDS初治患者、5例初治MDS轉(zhuǎn)白患者及5例正常對照組中檢測篩選出的micro RNA表達(dá)水平的驗證。挑選出具有明顯表達(dá)差異及統(tǒng)計學(xué)意義的micro RNA進行擴大樣本量的Real-time PCR檢測,檢測樣本包括52例初治MDS患者標(biāo)本(31例低危+中危1,21例中危2+高危)、16例初治MDS轉(zhuǎn)白患者標(biāo)本及19例正常對照者標(biāo)本,并分析它們的表達(dá)量與MDS患者臨床病理特征的相關(guān)性。通過生物信息學(xué)技術(shù)預(yù)測具有差異表達(dá)的mi R-320a在MDS中的直接靶基因,以及靶基因所富集的基因功能注釋和信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路。結(jié)合文獻(xiàn)報道篩選出差異表達(dá)的mi R-320a在MDS中的潛在靶基因。3、研究結(jié)果⑴、從前期研究的micro RNA芯片檢測結(jié)果中篩選出包括mi R-320a和mi R-320d在內(nèi)的7個具有表達(dá)差異的micro RNA。其中,mi R-320a和mi R-320d在MDS中的表達(dá)上調(diào)。利用Real-time PCR實驗在10例MDS患者、5例MDS轉(zhuǎn)白患者及5例正常對照組中檢測mi R-320a和mi R-320d的表達(dá)水平,結(jié)果顯示mi R-320a和mi R-320d的表達(dá)量在MDS各組中均高于在正常對照組(P0.05),且在中危2+高危組和MDS轉(zhuǎn)白組中的表達(dá)量均比在低危+中危1組中的表達(dá)量高。⑵、利用Real-time PCR實驗在52例MDS患者、16例MDS轉(zhuǎn)白患者及19例正常對照者中檢測mi R-320a/d的表達(dá)水平,結(jié)果顯示mi R-320a/d在總的MDS樣本中mi R-320a/d的表達(dá)量比正常對照組的表達(dá)量高,是正常對照組的3.18倍(P=1.35×10-6),并且在所有MDS亞組中的表達(dá)均比正常對照組的升高。mi R-320a/d在低危+中危1組中的表達(dá)量是正常對照組的1.87倍(P=1.00×10-4),在中危2+高危組中的表達(dá)量是正常對照組的3.78倍(P=6.65×10-9),在MDS轉(zhuǎn)白組中的表達(dá)量是正常對照組的4.74倍(P=5.22×10-11)。⑶、將MDS患者的骨髓原始細(xì)胞比例與mi R-320a/d在MDS中的表達(dá)量進行相關(guān)分析得出,MDS患者骨髓原始細(xì)胞比例與mi R-320a/d在MDS中的表達(dá)量呈正相關(guān)(r=0.76,P=8.40×10-10)。⑷、利用生物信息學(xué)技術(shù),預(yù)測mi R-320a的潛在靶基因,得到81個交集靶基因,結(jié)合文獻(xiàn)報道預(yù)測mi R-320a的靶基因為PCDH9。GO分析結(jié)果顯示,mi R-320a主要富集于縮短核轉(zhuǎn)錄m RNA poly(A)尾、m RNA分解代謝過程、蛋白結(jié)合作用、核孔復(fù)核體等基因功能注釋(P0.05)。Pathway分析結(jié)果顯示mi R-320a主要富集于軸突導(dǎo)向生長、RNA降解、結(jié)直腸癌形成、病毒介導(dǎo)的癌癥形成、溶酶體通路等信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路(P0.05)。GO分析及Pathway分析結(jié)果表明mi R-320a主要通過與m RNA相互作用參與了基因表達(dá)水平的調(diào)控,并在腫瘤的病理機制中起到重要的作用。4、研究結(jié)論⑴、mi R-320a/d在MDS患者中表達(dá)量明顯增高,且根據(jù)MDS危險度的增加,其表達(dá)水平明顯遞增,并且MDS患者骨髓原始細(xì)胞比例與mi R-320a/d在MDS中的表達(dá)量呈正相關(guān),提示它可能參與了MDS的發(fā)病機制和疾病進展。⑵、通過生物信息學(xué)分析mi R-320a在MDS中潛在的作用靶基因為PCDH9,提示mi R-320a在MDS中可能通過下調(diào)PCDH9來行使其生物學(xué)功能。
【關(guān)鍵詞】：microRNA 骨髓增生異常綜合征 miR-320a miR-320d 靶基因
【學(xué)位授予單位】：廣西醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號】：R551.3
【目錄】：

• 個人簡歷3-5
• 中文摘要5-8
• 英文摘要8-11
• 前言11-14
• 材料與方法14-26
• 實驗結(jié)果26-37
• 討論37-44
• 結(jié)論44-45
• 參考文獻(xiàn)45-53
• 附錄 縮略詞表53-54
• 綜述54-66
• 參考文獻(xiàn)61-66
• 致謝66-67
• 攻讀碩士期間發(fā)表的文章67-68

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1 黃瑩;miR-320在骨髓增生異常綜合征中的表達(dá)分析及其靶基因預(yù)測[D];廣西醫(yī)科大學(xué);2016年

  本文關(guān)鍵詞：miR-320在骨髓增生異常綜合征中的表達(dá)分析及其靶基因預(yù)測，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

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本文編號：420568