背景和目的:原發(fā)性肝細(xì)胞肝癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)是一類我國高發(fā)病率、高死亡率的惡性腫瘤,給我國人民健康造成了極大負(fù)擔(dān)。門靜脈癌栓(PVTT)是肝癌中一種常見的轉(zhuǎn)移形式之一,給肝癌治療帶來極大的困難。DNA甲基化異常是腫瘤發(fā)生發(fā)展的關(guān)鍵機(jī)制之一,因其穩(wěn)定且可以伴隨疾病發(fā)展或治療而變化,是一個潛在的理想生物標(biāo)志物。本研究通過全DNA甲基化分析對門靜脈癌栓特征進(jìn)行分析,探索門靜脈癌栓中可能存在的關(guān)鍵分子事件,并重點分析了DNAH17和ADRA1A兩個基因在肝細(xì)胞肝癌中甲基化改變情況。實驗方法:利用Infinium Human Methylation450芯片(病人數(shù)=11)對鄰近正常組織(ANT)、HCC組織和PVTTs進(jìn)行全基因組DNA甲基化分析。通過MTS實驗和凋亡實驗,以評估地西他濱(DAC)和腫瘤壞死因子相關(guān)的凋亡誘導(dǎo)配體(rh-TRAIL)對肝癌細(xì)胞系抑制的協(xié)同作用。在對DNAH17的研究中,主要使用Sequenom Epi TYPER法評估了163個HCC樣本及其配對正常組織中DNAH17的甲基化水平,并利用Taq Man拷貝數(shù)試劑盒分析來...

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【學(xué)位級別】：博士

【部分圖文】：

圖1（A）11例肝細(xì)胞肝癌患者癌旁、癌和門靜脈癌栓組織的整體甲基化水平；（B）以基因不同區(qū)域劃分，不同基因區(qū)域的平均甲基化水平；（C）以相對甲基化

浙江大學(xué)博士學(xué)位論文正文第一部分結(jié)果18圖1（A）11例肝細(xì)胞肝癌患者癌旁、癌和門靜脈癌栓組織的整體甲基化水平；（B）以基因不同區(qū)域劃分，不同基因區(qū)域的平均甲基化水平；（C）以相對甲基化島不同區(qū)域進(jìn)行劃分，不同甲基化島區(qū)域平均甲基化水平。3.2.2進(jìn)一步利用配對t檢驗或配對秩和檢....

圖2所有差異位點分析，利用曼哈頓圖進(jìn)行表示

浙江大學(xué)博士學(xué)位論文正文第一部分結(jié)果20圖2所有差異位點分析，利用曼哈頓圖進(jìn)行表示。橫坐標(biāo)代表染色體編號，縱坐標(biāo)代表差異位點的-log10（P）值。共三組比較組，分別為：HCCvs.ANT;HCCvs.PVTT;PVTTvs.ANT.3.2.3差異甲基化位點熱圖及聚類分析筆者整理....

圖3三組組織內(nèi)差異甲基化位點熱圖

浙江大學(xué)博士學(xué)位論文正文第一部分結(jié)果21點，在三組內(nèi)分別得到1771、3364和864個差異甲基化位點，進(jìn)一步筆者將這些差異甲基化位點重復(fù)位點進(jìn)行合并僅保留一項。進(jìn)而筆者得到5499個差異甲基化位點，并制作熱圖（圖3）。進(jìn)行聚類分析，筆者發(fā)現(xiàn)合并之后進(jìn)行聚類分析，甲基化位點主要分....

圖4染色體上甲基化差異位點的分布情況（A）低甲基化差異位點在各個染色體分布情況（B）高甲基化位點在各個染色體分布情況（C）甲基化差異位點在相對甲基化島位置的分布（D）甲基化差異位點在相對基因位置的分布

浙江大學(xué)博士學(xué)位論文正文第一部分結(jié)果23圖4染色體上甲基化差異位點的分布情況（A）低甲基化差異位點在各個染色體分布情況（B）高甲基化位點在各個染色體分布情況（C）甲基化差異位點在相對甲基化島位置的分布（D）甲基化差異位點在相對基因位置的分布3.3差異甲基化基因特征分析為進(jìn)一步探究....

本文編號：3974934