腸道微生物是抗生素抗性基因(ARGs)的儲存庫,為明確ARGs在魚腸道微生物中的組成特征,本研究以養(yǎng)殖鰻鱺為研究對象,利用高通量測序技術(shù)及功能宏基因組學(xué)分析方法對鰻鱺腸道微生物ARGs的種類和豐度進行了探究。研究結(jié)果顯示,養(yǎng)殖鰻鱺腸道微生物主要由厚壁菌門(Firmicutes)、梭桿菌門(Fusobacteria)、變形菌門(Proteobacteria)和擬桿菌門(Bacteroidetes)組成,比對抗性基因數(shù)據(jù)庫共注釋得到254種ARGs基因,分別歸屬于24類抗性類型,其中高豐度的抗性類型為多肽類抗生素、多重耐藥、氟喹諾酮類、四環(huán)素類和β-內(nèi)酰胺類。以上結(jié)果表明,在鰻鱺養(yǎng)殖過程中,出現(xiàn)耐多肽類抗生素、氟喹諾酮類、四環(huán)素類、β-內(nèi)酰胺類以及多重耐藥病原菌的機會相對較高。本研究為抗生素在鰻鱺養(yǎng)殖過程中合理使用提供參考依據(jù),同時也顯示宏基因組測序技術(shù)在檢測魚腸道ARGs的可行性和優(yōu)越性。

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 樣品采集
    1.2 主要試劑
    1.3 DNA提取與純化
    1.4 Illumina測序及高通量數(shù)據(jù)處理
2 結(jié)果與分析
    2.1 高通量測序序列數(shù)據(jù)分析
    2.2 鰻鱺腸道菌群結(jié)構(gòu)和多樣性分析
    2.3 鰻鱺腸道微生物基因組抗性基因分析結(jié)果
3 討論



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