目的探討胃癌免疫相關(guān)基因與患者預(yù)后和臨床指標(biāo)的相關(guān)性。方法通過癌癥基因組圖譜數(shù)據(jù)庫(kù)(TCGA)下載胃癌患者的臨床信息和基因表達(dá)信息,通過免疫相關(guān)基因數(shù)據(jù)庫(kù)(ImmPort)下載免疫相關(guān)基因列表,篩選出差異表達(dá)且影響胃癌術(shù)后總體生存率的免疫相關(guān)基因,然后與臨床指標(biāo)結(jié)合通過多因素COX回歸分析篩選出獨(dú)立影響預(yù)后的免疫相關(guān)基因。研究篩選出來的免疫相關(guān)基因與免疫細(xì)胞的相關(guān)性,以及與腫瘤微環(huán)境的相關(guān)性,并對(duì)篩選的基因進(jìn)行通路富集分析。結(jié)果 NOX4基因(χ²=4.2,P=0.041)、SLC22A17基因(χ²=6.6,P=0.010)、DKK1基因(χ²=7.4,P=0.007)為影響胃癌預(yù)后的獨(dú)立風(fēng)險(xiǎn)基因。在胃癌中NOX4基因、SLC22A17基因與B細(xì)胞、CD8⁺T細(xì)胞、CD4⁺T細(xì)胞、巨噬細(xì)胞、中性粒細(xì)胞、樹突狀細(xì)胞的浸潤(rùn)量均有相關(guān)性(均P<0.05),DKK1基因與CD8⁺T細(xì)胞和巨噬細(xì)胞的浸潤(rùn)量具有相關(guān)性(均P<0.05)。通過腫瘤微環(huán)境評(píng)分...

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圖4預(yù)后免疫相關(guān)基因在正常組織和腫瘤組織的表達(dá)量

通過R軟件,采用Kruskal-Wallis檢驗(yàn)方法對(duì)病理分級(jí)和病理分期(T、N、M)進(jìn)行檢驗(yàn)。NOX4、SLC22A17、DKK1基因的表達(dá)在N分期和M分期中均無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異,因此未繪制圖形。如圖5所示:在T分期中,隨著T分期的進(jìn)展NOX4基因和SLC22A17基因表達(dá)量有逐漸增....

圖5預(yù)后免疫相關(guān)基因與臨床病理指標(biāo)相關(guān)性分析

圖4預(yù)后免疫相關(guān)基因在正常組織和腫瘤組織的表達(dá)量2.7預(yù)后免疫相關(guān)基因與免疫細(xì)胞浸潤(rùn)量的相關(guān)性分析

圖6GO、KEGG基因通路富集分析

通過R軟件“org.Hs.eg.db”包對(duì)影響胃癌術(shù)后總體生存率的20個(gè)基因進(jìn)行GO(GeneOntology)通路富集分析和KEGG(KyotoEncyclopediaofGenesandGenomes)通路富集分析。將20個(gè)基因全部納入后,富集分析分析的通路相對(duì)更....

圖1臨床指標(biāo)單因素COX回歸分析

如圖1所示,通過對(duì)臨床指標(biāo)進(jìn)行單因素COX回歸分析發(fā)現(xiàn):年齡[HR=1.020,95%CI:1.003～1.037,P=0.019]、T分期[HR=1.369,95%CI:1.102～1.702,P=0.005]、M分期[HR=2.502,95%CI:1.435～4.365,P=....

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