目的研究阿爾茨海默病患者外周血差異基因的分子功能分類(lèi)、生物學(xué)網(wǎng)絡(luò)調(diào)控特征及關(guān)鍵節(jié)點(diǎn),為阿爾茨海默病的臨床早期診斷和防治提供新方法和新思路。方法從基因芯片公共數(shù)據(jù)庫(kù)GEO中下載阿爾茨海默病患者外周血的基因芯片數(shù)據(jù),采用PANTHER在線平臺(tái)對(duì)40個(gè)差異表達(dá)基因進(jìn)行GO分析,包括基因類(lèi)別、分子功能、生物學(xué)過(guò)程及信號(hào)通路分析,使用在線分析軟件STRING對(duì)差異表達(dá)基因進(jìn)行生物信息學(xué)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)分析,尋找關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)基因及其相互作用關(guān)系。結(jié)果 20個(gè)明顯下調(diào)的差異基因主要與機(jī)體防御/免疫功能、細(xì)胞黏附及能量代謝功能相關(guān),與丙酮酸代謝信號(hào)通路相關(guān),蛋白相互作用拓?fù)渚W(wǎng)絡(luò)中的關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)ATP6V1F、PIGQ、GLO1分別與能量代謝、信號(hào)傳導(dǎo)、氧化應(yīng)激子網(wǎng)絡(luò)有關(guān)。而20個(gè)明顯上調(diào)的差異基因主要與氧化還原、代謝過(guò)程及細(xì)胞轉(zhuǎn)運(yùn)功能相關(guān),蛋白相互作用拓?fù)渚W(wǎng)絡(luò)中的關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)OGT、GYG1、UXS1、ATP2A2分別與分別與糖基化修飾、糖原合成、葡萄糖醛酸酯合成及ATP能量代謝子網(wǎng)絡(luò)有關(guān)。結(jié)論阿爾茨海默病的發(fā)病機(jī)理與外周血中的ATP6V1F、PIGQ、GLO1、OGT、GYG1、UXS1及ATP2A2等基因的變化密切相...

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圖1下調(diào)基因的PPI相互作用拓?fù)渚W(wǎng)絡(luò)

如圖3所示,STRING蛋白相互作用在線分析結(jié)果表明,上調(diào)的20個(gè)基因表達(dá)的蛋白之間存在相互作用關(guān)系,構(gòu)成的蛋白拓?fù)渚W(wǎng)絡(luò)中包含5個(gè)子網(wǎng)絡(luò),分別與糖基化修飾、糖原合成、丙三醇代謝、葡萄糖醛酸酯合成及ATP能量代謝密切相關(guān)。其中,OGT為糖基化修飾相關(guān)子網(wǎng)絡(luò)的關(guān)鍵節(jié)點(diǎn),與子網(wǎng)絡(luò)中的其....

圖3上調(diào)基因的PPI網(wǎng)絡(luò)

圖2下調(diào)基因及上調(diào)基因的相互作用團(tuán)簇2.3.2下調(diào)基因的生物學(xué)過(guò)程及信號(hào)通路分析結(jié)果

圖2下調(diào)基因及上調(diào)基因的相互作用團(tuán)簇

PANTHER平臺(tái)蛋白分類(lèi)結(jié)果表明,下調(diào)基因表達(dá)的蛋白可分為8個(gè)類(lèi)別,每種類(lèi)別包含的基因及占總基因數(shù)量的百分比見(jiàn)表3。PANTHER平臺(tái)分子功能分類(lèi)結(jié)果表明,下調(diào)基因的分子功能可分為4個(gè)類(lèi)別,每種分子功能包含的基因及占總基因數(shù)量的百分比見(jiàn)表4。圖3上調(diào)基因的PPI網(wǎng)絡(luò)

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