發(fā)布時間：2024-02-14 05:12

　　為明確SPL(Squamosa Promoter Binding Protein Like)在莧菜中的功能,基于‘全紅’莧菜轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫篩選獲得17個SPL家族成員,并進行生物信息學(xué)分析預(yù)測。結(jié)果表明,17個AmSPL蛋白分別由186～777個氨基酸組成,相對分子量從20.53～88.27ku。構(gòu)建AmSPL與擬南芥(Arabidopsis thaliana L.)16個AtSPL成員系統(tǒng)進化樹,并根據(jù)AtSPLs基因家族的分類標準將AmSPL成員分為6組。實時熒光定量PCR分析表明,在黑暗條件下,AmSPLs的表達量均高于藍光下,推測AmSPLs的表達可能通過某種方式受到藍光的負調(diào)控。預(yù)測分析其中的8個AmSPL可能是miR156的靶基因。

【文章頁數(shù)】：11 頁

【部分圖文】：

圖4Am-miR156a-5p、Am-miR156-1與8個AmSPLs互補序列的序列比對

由圖4可知，17個AmSPL家族成員中有8個成員含有與miR156成熟體互補序列，分別為AmSPL1,AmSPL2,AmSPL4,AmSPL5,AmSPL6,AmSPL7,AmSPL8和AmSPL13，初步表明這8個AmSPLs可能是miR156的靶基因。2.5AmSPL基因家....

圖5莧菜AmSPLs的qRT-PCR定量結(jié)果與其對應(yīng)的FPKM值

目前基于全基因組研究的深入，越來越多物種的SPL基因家族被鑒定出來，其中擬南芥中發(fā)現(xiàn)16個，水稻19個，小麥58個，番茄15個。然而對于沒有全基因組的物種更多的是通過轉(zhuǎn)錄組進行分析鑒定。SPL是植物的特異性轉(zhuǎn)錄因子，含有高度保守的SBP結(jié)構(gòu)域[35]，它能夠與花分生組織中的特性基....

圖1AmSPL家族進化樹（a）及蛋白結(jié)構(gòu)分析（b)

由圖3可知，33個SPL成員共分為6個組，GroupⅠ含有9個AmSPL家族蛋白，分別為AmSP4,AmSPL12,AmSPL14,AmSPL17,AmSPL2,AmSPL1,AmSPL15,AmSPL3和AmSPL16，并含有4個AtSPL家族蛋白；GroupⅡ含有Am....

圖2AmSPL家族蛋白SBP保守結(jié)構(gòu)域

圖1AmSPL家族進化樹（a）及蛋白結(jié)構(gòu)分析（b)圖3‘全紅’莧菜（Am）與擬南芥（At)SPL家族蛋白系統(tǒng)進化樹

本文編號：3897796