管紋艷虎天牛UDP-葡萄糖基轉(zhuǎn)移酶基因的鑒定及表達(dá)特征分析
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【部分圖文】:
圖1管紋艷虎天牛UGT的氨基酸序列比對(duì)
根據(jù)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的FPKM值,研究了36個(gè)RhorUGTs基因在雌雄蟲(chóng)觸角、跗節(jié)以及不含觸角和跗節(jié)的身體等組織中的表達(dá)情況。結(jié)果表明,所有RhorUGTs基因在檢測(cè)的一至多個(gè)組織中有表達(dá);大部分基因(21個(gè))在檢測(cè)的所有組織中均有不同程度的表達(dá);部分基因呈現(xiàn)組織特異表達(dá)的特點(diǎn),如R....
圖2鞘翅目昆蟲(chóng)UGT的進(jìn)化樹(shù)
圖1管紋艷虎天牛UGT的氨基酸序列比對(duì)2.4RhorUGT17三級(jí)結(jié)構(gòu)建模及分析
圖3管紋艷虎天牛RhorUGTs基因在成蟲(chóng)不同組織的表達(dá)譜
以HsapUGT2B7的晶體結(jié)構(gòu)為模板,采用同源建模的方法構(gòu)建了RhorUGT17的三級(jí)結(jié)構(gòu)。首先,根據(jù)HsapUGT2B7晶體結(jié)構(gòu)的氨基酸序列和其與RhorUGT17的序列比對(duì)結(jié)果,截取RhorUGT17相應(yīng)C端區(qū)域的170個(gè)氨基酸,氨基酸序列比對(duì)結(jié)果表明兩者的一致性為42%。....
圖4管紋艷虎天牛RhorUGT17的三級(jí)結(jié)構(gòu)
圖3管紋艷虎天牛RhorUGTs基因在成蟲(chóng)不同組織的表達(dá)譜同源建模結(jié)果表明,RhorUGT17由N端、C端、loop環(huán)、7個(gè)α螺旋(α1-7)和6個(gè)β折疊(β1-6)組成。此外,為了比較HsapUGT2B7和RhorUGT17的三級(jí)結(jié)構(gòu)差異,進(jìn)一步將它們的結(jié)構(gòu)進(jìn)行疊加。結(jié)果發(fā)....
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