為研究Glyma.05G222700.2基因編碼的絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶在抗非生物脅迫過程的功能和原理,促進大豆抗逆候選基因的開發(fā)利用,本研究通過生物信息學(xué)方法對大豆Glyma.05G222700.2基因進行同源序列、蛋白結(jié)構(gòu)、進化樹和轉(zhuǎn)錄組分析,通過qRT-PCR分析鹽脅迫下大豆不同組織中該基因的表達情況。結(jié)果表明:該基因編碼區(qū)長2 040 bp,編碼697個氨基酸,預(yù)測分子量為656.54 kD,pI8.026。多序列比對發(fā)現(xiàn)Glyma.05G222700.2蛋白包含1個Pkinase結(jié)構(gòu)域。進化樹分析表明該蛋白與野大豆、刺毛黧豆、赤豆一致性較高。轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)表明Glyma.05G222700.2基因在大豆各組織中均有表達,其中在種子中表達量最高,在根中表達量最低。qRT-PCR結(jié)果發(fā)現(xiàn)Glyma.05G222700.2基因在毛狀根、莖、葉中均有表達,在莖中表達量最高,在葉中表達量最低;在毛狀根中鹽脅迫12 h表達量達到極值,鹽脅迫24 h表達量下降;在莖中表達量呈上升趨勢,在24 h表達量達到極值;在葉中表達量不穩(wěn)定,鹽脅迫2 h該基因不表達,鹽脅迫6 h該基因表達量達到極值并高于...

【文章頁數(shù)】：6 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 材料
    1.2 試驗設(shè)計
    1.3 方法
        1.3.1 生物信息學(xué)分析
        1.3.2 總RNA提取
        1.3.3 cDNA合成
        1.3.4 qRT-PCR
    1.4 數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 Glyma.05G222700.2基因序列分析
    2.2 Glyma.05G222700.2蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測
    2.3 Glyma.05G222700.2基因組織特異性表達預(yù)測與檢測
    2.4 Glyma.05G222700.2基因在鹽脅迫下的表達量分析
3 討 論
4 結(jié) 論



本文編號：3875186