應用生物信息學方法對12種鳚亞目魚類線粒體COI基因序列片段進行了比較分析。結果表明:COI基因堿基組成偏倚明顯,A+T含量(54.40%)明顯高于G+C含量(45.60%)。轉(zhuǎn)換和顛換位點數(shù)分別為59和42個。應用Kimura雙參數(shù)法計算鳚亞目魚類COI基因序列的種間遺傳距離,結果表明:種間平均遺傳距離為0.232 4,是種內(nèi)遺傳距離的9.62倍。應用MP和NJ法構建了分子系統(tǒng)發(fā)生樹,結果顯示,方氏云鳚、云鳚和六線鳚聚在一起,然后與頸鰭脂鳚聚在一起,再與巴西擬隆胎鳚、巴哈馬擬隆胎鳚聚類,最后與疣眼吉氏指鰧聚類;粗頭巖游鳚、環(huán)項副鳚和橫帶斯氏脂胎鳚聚為另一分支;背叉觸角鳚并沒有聚成一個單系分支,而是與旗鳚科和三鰭鳚科的魚類交叉。此外,分子系統(tǒng)發(fā)生樹的構建結果大部分與形態(tài)學分類結果相一致,相比之下,NJ法較MP法構建的分子系統(tǒng)發(fā)生樹與鳚亞目魚類形態(tài)學分類結果更接近。

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 試驗材料
    1.2 數(shù)據(jù)分析
2 結果與分析
    2.1 COI基因堿基組成
    2.2 種內(nèi)及種間遺傳距離
    2.3 分類及系統(tǒng)發(fā)育關系
3 討論
    3.1 鳚亞目魚類線粒體COI基因結構特征
    3.2 鳚亞目魚類分類關系的探討
4 結論



本文編號：3843612