白菜型冬油菜ELIP1基因的克隆與低溫表達分析
發(fā)布時間:2023-04-22 23:19
為探討ELIP1基因在冬油菜抗寒中的作用,克隆白菜型冬油菜ELIP1基因的CDS序列,并對其功能結(jié)構(gòu)域、系統(tǒng)進化和不同抗寒品種間在低溫下的表達特性進行分析。結(jié)果表明,ELIP1蛋白編碼195個氨基酸,預(yù)測分子質(zhì)量為20.472 8 ku,等電點9.24。序列比對分析表明,ELIP1基因在弱抗寒品種發(fā)生突變位置少于抗寒品種;進化樹分析結(jié)果顯示,弱抗寒品種‘Lenox’和‘Neib’聚為一類,‘天油2號’‘天油4號’‘隴油6號’‘隴油7號’‘隴油8號’和‘隴油9號’聚為一大類。qRT-PCR分析表明,冬油菜ELIP1基因在不同抗寒品種間存在表達差異,低溫下,ELIP1基因在超強抗寒品種中表達水平顯著高于抗寒性相對較弱的品種,說明ELIP1基因在冬油菜響應(yīng)冷脅迫中具有重要作用。
【文章頁數(shù)】:8 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材 料
1.2 試驗設(shè)計
1.3 方 法
1.3.1 RNA提取及反轉(zhuǎn)錄
1.3.2 引物設(shè)計與ELIP1基因克隆
1.3.3 ELIP1預(yù)測蛋白的生物信息學分析
1.4 白菜型冬油菜 ELIP1基因的熒光定量表達分析
2 結(jié)果與分析
2.1 ELIP1基因克隆
2.2 白菜型冬油菜 ELIP1基因編碼蛋白質(zhì)的特性分析
2.3 各品種白菜型冬油菜 ELIP1基因核苷酸序列對比
2.4 各白菜型冬油菜品種ELIP1蛋白系統(tǒng)進化樹構(gòu)建與分析
2.5 低溫脅迫對不同冬油菜品種ELIP1表達的影響
3 結(jié)論與討論
本文編號:3798603
【文章頁數(shù)】:8 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材 料
1.2 試驗設(shè)計
1.3 方 法
1.3.1 RNA提取及反轉(zhuǎn)錄
1.3.2 引物設(shè)計與ELIP1基因克隆
1.3.3 ELIP1預(yù)測蛋白的生物信息學分析
1.4 白菜型冬油菜 ELIP1基因的熒光定量表達分析
2 結(jié)果與分析
2.1 ELIP1基因克隆
2.2 白菜型冬油菜 ELIP1基因編碼蛋白質(zhì)的特性分析
2.3 各品種白菜型冬油菜 ELIP1基因核苷酸序列對比
2.4 各白菜型冬油菜品種ELIP1蛋白系統(tǒng)進化樹構(gòu)建與分析
2.5 低溫脅迫對不同冬油菜品種ELIP1表達的影響
3 結(jié)論與討論
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