目的:開發(fā)一套基于短串聯(lián)重復(fù)序列(STR)標(biāo)記和毛細(xì)管電泳法進(jìn)行異基因造血干細(xì)胞移植(allo-HSCT)后嵌合率檢測時(shí)可自動數(shù)據(jù)分析和報(bào)告的工具軟件,以提高工作效率。方法:采用Apache+MySQL+PHP+HTML5技術(shù)搭建數(shù)據(jù)庫和訪問界面,根據(jù)基于STR和毛細(xì)管電泳法判別STR位點(diǎn)基因型和計(jì)算嵌合率的規(guī)則設(shè)定分析邏輯和流程。抽取100例allo-HSCT患者的STR分型和移植后194次嵌合率檢測數(shù)據(jù),應(yīng)用此平臺進(jìn)行自動STR位點(diǎn)分型鑒定、嵌合率計(jì)算及生成報(bào)告。結(jié)果:所搭建的分析平臺可實(shí)現(xiàn)自定義STR位點(diǎn)、基因型智能識別、嵌合比例自動分析、檢測信息數(shù)據(jù)庫化管理,可自動生成含該患者多次檢測、多種不同成分細(xì)胞嵌合比例結(jié)果的整合報(bào)告和嵌合比例趨勢圖等功能,并且可通過瀏覽器多用戶同時(shí)訪問和使用。應(yīng)用該平臺自動分析和有經(jīng)驗(yàn)人員的手工分析結(jié)果完全一致,并且通過自動化減少了手工分析失誤的可能。使用該平臺自動分析所用時(shí)間約為手工分析的1/6-1/5。結(jié)論:本研究搭建的嵌合率自動分析平臺運(yùn)行穩(wěn)定、位點(diǎn)分型和嵌合率分析結(jié)果可信,可提高工作效率和報(bào)告內(nèi)涵,具有推廣應(yīng)用價(jià)值。

【文章頁數(shù)】：7 頁

【文章目錄】：
材料和方法
    病例資料
    嵌合率檢測實(shí)驗(yàn)流程
    位點(diǎn)鑒定算法
    嵌合率算法
    涉及stutter峰修正情況的算法
    分析流程和平臺搭建
    數(shù)據(jù)源
    自定義分析位點(diǎn)
    STR位點(diǎn)基因型智能識別
    嵌合結(jié)果自動分析
    自動生成含多次檢測結(jié)果的整合報(bào)告和嵌合比例趨勢圖
    平臺使用流程
    平臺效能評估
結(jié)果
    病例收集
    平臺評估結(jié)果
討論



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