該研究基于黃瓜基因組數(shù)據(jù)庫,利用生物信息學和熒光定量PCR等方法,對黃瓜SOS2基因家族進行全基因組鑒定,并對其表達特性進行系統(tǒng)分析。結(jié)果表明:(1)在黃瓜基因組中,共鑒定到15個SOS2基因(CsSOS2-1～CsSOS2-15),且不均勻分布在5條染色體上;亞細胞定位顯示SOS2蛋白主要位于細胞質(zhì)膜。(2)系統(tǒng)進化分析顯示,CsSOS2-2和CsSOS2-6與AtSOS2親緣關(guān)系更近。(3)順式作用元件預測顯示,SOS2基因啟動子序列主要含有干旱誘導和防御應激響應元件。(4)結(jié)構(gòu)分析顯示,SOS2蛋白所含保守基序的排列順序完全一致,且主要含有STKc和NAF保守結(jié)構(gòu)域,這些結(jié)構(gòu)可能在基因響應鹽脅迫過程中起調(diào)控作用。(5)熒光定量試驗表明,SOS2基因家族主要在黃瓜的根和葉片響應鹽脅迫時上調(diào)表達,其中,鹽脅迫處理1 d時有5個基因上調(diào)表達,并隨處理時間延長鹽脅迫下的基因表達有所下調(diào);增施多胺顯著上調(diào)了CsSOS2-1～CsSOS2-5、CsSOS2-8、CsSOS2-9、CsSOS2-12和CsSOS2-15在不同組織中的表達,說明鹽脅迫下多胺能誘導黃瓜SOS2基因家族的表達,進而參...

【文章頁數(shù)】：11 頁

【文章目錄】：
1 材料和方法
    1.1 試驗材料
    1.2 SOS2基因家族鑒定
        1.2.1 黃瓜SOS2基因家族成員篩選
        1.2.2 黃瓜SOS2基因家族蛋白理化性質(zhì)分析
        1.2.3 黃瓜SOS2基因家族成員的染色體定位
        1.2.4 黃瓜SOS2基因家族系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建
        1.2.5 黃瓜SOS2基因的順式作用元件預測
        1.2.6 黃瓜SOS2蛋白保守結(jié)構(gòu)域及保守基序分析
    1.3 qRT-PCR定量分析
    1.4 數(shù)據(jù)處理
2 結(jié)果與分析
    2.1 黃瓜SOS2基因家族成員鑒定及理化性質(zhì)分析
    2.2 黃瓜SOS2基因家族成員染色體定位
    2.3 黃瓜SOS2蛋白的遺傳進化分析
    2.4 黃瓜SOS2基因家族的順式作用元件預測
    2.5 黃瓜SOS2蛋白的結(jié)構(gòu)分析
    2.6 黃瓜SOS2基因家族表達分析
3 討 論



本文編號：3775397