發(fā)布時間：2023-03-19 21:42

　　【目的】篩選并分析菠蘿TCP(Teosinte branched 1/Cycloidea/Proliferating)基因家族,為菠蘿TCP基因在乙烯利誘花過程中的功能研究提供參考。【方法】以‘臺農16號’菠蘿為材料,通過生物信息學軟件系統(tǒng)地分析該基因家族的蛋白質理化性質、染色體定位、基因共線性、系統(tǒng)進化、基因結構、啟動子順式作用元件及RNA-Seq數(shù)據(jù),并通過qRTPCR分析該基因家族在成花誘導階段的表達情況�！窘Y果】共鑒定出9個菠蘿TCP基因,均含有TCP結構域,系統(tǒng)進化將其劃分為PCF、CIN和CYC/TB1三個亞家族。菠蘿TCP基因家族的擴增與全基因組倍增事件無關,不存在片段復制和串聯(lián)復制事件。啟動子順式作用元件分析發(fā)現(xiàn),AcTCP2、AcTCP5～AcTCP9均含有乙烯響應元件。表達譜分析表明,AcTCP對乙烯利均有不同程度的響應,在花芽分化時期,AcTCP1、AcTCP3、AcTCP7和AcTCP8在莖尖中的表達水平均有顯著上調,分別約為0時期的8.15、18.0、14.6和7.91倍�！窘Y論】鑒定并分析了AcTCP基因家族成員信息,發(fā)現(xiàn)AcTCP1、AcTCP3、AcTC...

【文章頁數(shù)】：13 頁

【文章目錄】：
1 材料和方法
    1.1 材料及處理
    1.2 菠蘿TCP基因家族的鑒定
    1.3 菠蘿TCP基因家族的生物信息學分析
    1.4 菠蘿TCP基因家族RNA-Seq表達分析
    1.5 菠蘿TCP基因家族的q RT-PCR分析
2 結果與分析
    2.1 菠蘿TCP基因家族染色體定位及蛋白質理化性質分析
    2.2 菠蘿TCP基因共線性分析
    2.3 菠蘿TCP基因家族的系統(tǒng)進化分析
    2.4 菠蘿TCP結構分析
    2.5 菠蘿TCP啟動子順式作用元件分析
    2.6 mi RNA的靶基因預測
    2.7 基于RNA-Seq數(shù)據(jù)的菠蘿TCP表達分析
    2.8 菠蘿TCP基因的q RT-PCR分析
3 討論



本文編號：3766038