研究目的:本研究通過對2016-2018年青島地區(qū)手足口病病原學(xué)和柯薩奇病毒A6型基因組特征研究,以了解手足口病的病原譜流行特征,明確CA6的遺傳變異特征,為今后CA6所致HFMD的防控奠定基礎(chǔ)。研究方法:青島市10個區(qū)市設(shè)有HFMD病原學(xué)監(jiān)測哨點,樣本全部由哨點醫(yī)院根據(jù)衛(wèi)生部發(fā)布的《手足口病預(yù)防控制指南(2014年版)》采集并登記病例信息。采用熒光定量PCR的方法對青島市2016-2018年手足口病咽拭子標(biāo)本進行總腸道病毒(Enterovirus,EV)檢測,對EV陽性標(biāo)本進行常見腸道病毒的分型鑒定(包括腸道病毒71型(EV71)、柯薩奇病毒A16型、A6型和A10型),將腸道病毒的熒光RT-PCR檢測CA6陽性標(biāo)本接種于RD細胞上進行病毒分離,7日后收取上清進行核酸提取及逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR),選取病毒量較高的(CT值小于25)CA6毒株進行VPl基因全長及全基因組擴增,測序結(jié)果用Sequencher軟件進行序列拼接,用ClustalX 2.0比對序列后,導(dǎo)入Mega 7.0軟件進行序列比對及系統(tǒng)進化分析,用于建立系統(tǒng)發(fā)生樹的CA6參考序列選自GenBank中腸道病毒...

【文章頁數(shù)】：57 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
abstract
引言
    1.手足口病簡介
    2.腸道病毒病原學(xué)
    3.手足口病流行情況
    4.手足口病臨床癥狀
材料和方法
    1.標(biāo)本來源
    2.標(biāo)本的處理
    3.腸道病毒核酸提取及熒光定量RT-PCR檢測
    4.腸道病毒分離培養(yǎng)
    5.CA6型別基因擴增
    6.VP1及全基因序列比對及系統(tǒng)發(fā)生分析
    7.重組分析
    8.統(tǒng)計學(xué)處理
結(jié)果
    1.2016-2018年青島地區(qū)HFMD病原學(xué)流行概況
    2.基于CA6 VP1區(qū)種系進化分析
    3.基于CA6全基因種系遺傳進化分析
    4.青島CA6毒株核苷酸和氨基酸變異分析
    5.CA6全基因毒株同源性分析
    6.CA6毒株全基因序列重組分析
討論
結(jié)論
參考文獻
綜述
    綜述參考文獻
攻讀學(xué)位期間的研究成果
縮略詞表
致謝



本文編號：3748214