目的基于數據庫篩選胃癌相關差異表達基因,分析胃癌相關差異表達基因的生物學功能及相關信號通路,探索胃癌相關核心差異表達基因與胃癌預后的關系。方法從GEO數據庫選取胃癌相關基因芯片GSE79973、GSE54129,應用GEO2R分別篩選出兩組芯片胃癌組織與正常胃黏膜組織的差異表達基因,取交集后得到共有差異表達基因。應用DAVID對差異表達基因進行生物學功能及信號通路分析。采用STRING構建差異表達基因蛋白互作網絡,應用Cytoscape軟件的MCODE插件篩選胃癌相關核心差異表達基因。對核心差異表達基因與胃癌預后的關系進行分析。結果相對于正常胃黏膜組織,胃癌組織差異表達基因共164個,其中42個上調、122個下調,主要存在于胞外區(qū)、蛋白細胞外基質、細胞外基質、細胞外外泌體等部位,主要涉及細胞外基質受體相互作用、局部黏附、蛋白質消化和吸收、細胞色素P450代謝等相關通路。初步篩選出13個胃癌相關核心基因（COL1A2、BGN、THBS2、FN1、THBS1、COL1A1、COL4A1、SPARC、COL11A1、COL6A3、COL12A1、TIMP1、SPP1）,除THBS1外,其余1... 

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 胃癌相關基因芯片基本信息與質量分析
    1.2 兩組差異表達基因篩選
    1.3 胃癌差異表達基因生物學功能與信號通路分析
    1.4 胃癌相關核心基因的篩選
    1.5 胃癌預后相關基因分析
2 結果
    2.1 胃癌組織與正常胃黏膜組織差異表達基因
    2.2 胃癌相關差異表達基因生物學功能與信號通路
    2.3 胃癌相關核心差異表達基因
    2.4 胃癌相關核心差異表達基因與胃癌預后的關系
3 討論


【參考文獻】：
期刊論文
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