【目的】新城疫（ND）是中國流行最嚴重的疫病之一,對家禽業(yè)可造成巨大的經(jīng)濟損失,疫苗防控是控制ND的重要措施。新城疫病毒（NDV）流行株的遺傳演化一直是研究NDV的焦點。本文利用分子信息學手段,通過比較近20年間NDV流行株不同基因型F和HN基因的分子特征和遺傳變異頻率,解析免疫壓力下NDV的演化規(guī)律�！痉椒ā坷肔asergene 7.1和MEGA5.1軟件,選取本實驗室89株NDV分離株,結(jié)合從Gen Bank下載的364株NDV流行株以及15株NDV經(jīng)典毒株的基因序列,對其進行系統(tǒng)發(fā)育、分子特征和替代頻率分析。【結(jié)果】系統(tǒng)發(fā)育表明,NDV已經(jīng)演化為15個基因型。一致性比較顯示,NDV流行株相同基因型之間核苷酸（氨基酸）高度同源,而不同基因型之間差異較大且存在明顯的氨基酸變異積累。NDV基因型的分布與時間、地域密切相關(guān),VII d亞型為中國NDV優(yōu)勢流行株。為評估NDV變異的頻率,以Go/GD/QY/1997株（中國較早發(fā)生的基因VII亞型）為參照,1997-2015年間NDV的F/HN基因的年平均核苷酸（氨基酸）替代率為2.31×10^-3(2.26×10

【文章頁數(shù)】：9 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 NDV基因序列來源
    1.2 方法
2 結(jié)果與分析
    2.1 系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建
    2.2 相似性比較
    2.3 F和HN遺傳變異及其與年代的相關(guān)性
        2.3.1 NDV流行株與經(jīng)典疫苗株的核酸差異比較:
        2.3.2 不同基因型NDV的核苷酸年平均替代率的比較:
        2.3.3 NDV基因VII型的年平均核苷酸/氨基酸進化率:
    2.4 NDV基因VII型的關(guān)鍵氨基酸位點分析
3 討論
    3.1 NDV基因型的多樣性和復雜性
    3.2 NDV變異頻率的探討
    3.3 NDV變異對于疫苗防控的啟示


【參考文獻】：
期刊論文
[1]近20年中國部分地區(qū)雞源H9N2亞型禽流感病毒HA基因遺傳演化及其變異頻率[J]. 孟芳,徐懷英,張偉,黃迪海,張再輝,劉霞,常維山,秦卓明.  微生物學報. 2016(01)
[2]新城疫病毒抗原性和核心基因的動態(tài)演化及防控思考[J]. 秦卓明,徐懷英,劉玉山,黃兵,李玉峰.  中國家禽. 2011(14)
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博士論文
[1]2008-2013年華東地區(qū)新城疫病毒分子流行病學及HN基因E347K變異對病毒抗原性的影響[D]. 朱杰.揚州大學 2015
[2]新城疫病毒山東流行株分子演化及抗原性變異分析[D]. 徐懷英.中國農(nóng)業(yè)大學 2014
[3]新城疫病毒流行株致病性和抗原性及其與F和HN基因變異的相關(guān)性[D]. 秦卓明.山東農(nóng)業(yè)大學 2006



本文編號：3717442