“丁氏”核心種質(zhì)（150份）具有豐富遺傳變異,對于水稻非生物脅迫（鋁毒和冷害）研究具有重要價值。本研究對群體進行全基因組簡化測序,分析其結(jié)構(gòu)分層與遺傳關(guān)系;并結(jié)合耐鋁表型數(shù)據(jù)（相對根長）與耐冷表型數(shù)據(jù)（死苗率）對核心種質(zhì)群體進行抗逆性的全基因組關(guān)聯(lián)分析（GWAS）（混合線性模型）,挖掘及驗證水稻核心種質(zhì)中優(yōu)異抗逆基因。研究結(jié)果簡述如下:（1）SLAF-seq測序標記的高密度SNP位點,群體結(jié)構(gòu)分析結(jié)果顯示群體分為2-4個亞群。采用GWAS方法,鑒定到153個與耐鋁顯著關(guān)聯(lián)的SNP位點,并定位30個與耐鋁相關(guān)的QTL,其中6個QTL與前人研究結(jié)果共定位。進一步對具有較高顯著性SNP位點（qALT3.2、qALT3.3、qALT3.4、qALT3.5,qALT1.2、qALT1.5、qALT2.3、qALT3.6、qALT3.7、qALT4.1、qALT6.1,和qALT9.1）所在QTL區(qū)域的候選基因進行RT-PCR檢測、基因注釋分析、氨基酸序列分析以及表達譜分析的多重篩選,最終定位到兩個與耐鋁相關(guān)的新基因（Os03g0437200與Os01g0304100）,對這兩個基因的功能驗證有待... 

【文章頁數(shù)】：92 頁

【學位級別】：博士

【部分圖文】：

世界水稻產(chǎn)量與消耗量變化預測

植物低溫應答的基因調(diào)控網(wǎng)絡Figure1-2Networksofplantcold-responsivegeneregulatory本圖引用肖寧等.2016

水稻耐冷性相關(guān)QTLFigure1-3QTLrelatedtocoldtoleranceinrice

【參考文獻】：
期刊論文
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博士論文
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碩士論文
[1]黑龍江省水稻骨干親本對衍生品種的遺傳貢獻及孕穗期耐冷性的關(guān)聯(lián)分析[D]. 王允祥.東北農(nóng)業(yè)大學 2017
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本文編號：3716906