基于支持向量機(jī)遞歸特征消除篩選急性心肌梗死相關(guān)免疫基因診斷急性心肌梗死的價(jià)值
發(fā)布時(shí)間:2022-10-10 17:37
目的基于支持向量機(jī)(SVM)遞歸特征消除(RFE)(SVM-RFE)篩選急性心肌梗死(AMI)相關(guān)的關(guān)鍵免疫基因,并探討其在AMI中的診斷價(jià)值。方法通過(guò)基因芯片表達(dá)數(shù)據(jù)庫(kù)(GEO)獲取AMI患者基因表達(dá)芯片數(shù)據(jù)集GSE66360。通過(guò)SVM-RFE篩選AMI相關(guān)的免疫基因,進(jìn)而用受試者工作特征(ROC)曲線評(píng)估其對(duì)AMI的診斷價(jià)值。結(jié)果共得到66個(gè)差異免疫基因,基于SVM-RFE最終得到8個(gè)免疫基因用于構(gòu)建SVM分類(lèi)器,該基因分類(lèi)器在探索隊(duì)列(AUC=0.998)和驗(yàn)證隊(duì)列(AUC=1.00)中都具有極好的預(yù)測(cè)AMI的能力。通路富集分析特征基因主要參與血管平滑肌細(xì)胞增殖的調(diào)控及血管動(dòng)脈硬化等過(guò)程。結(jié)論本研究識(shí)別出8個(gè)關(guān)鍵的免疫基因,發(fā)現(xiàn)其在AMI診斷中的潛在作用,并將增進(jìn)對(duì)AMI發(fā)生的分子機(jī)制的了解。
【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]腫瘤壞死因子受體相關(guān)因子參與炎癥免疫調(diào)節(jié)的研究進(jìn)展[J]. 李影,陳鏡宇,張玲玲,魏偉. 中國(guó)藥理學(xué)通報(bào). 2015(09)
本文編號(hào):3690063
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【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]腫瘤壞死因子受體相關(guān)因子參與炎癥免疫調(diào)節(jié)的研究進(jìn)展[J]. 李影,陳鏡宇,張玲玲,魏偉. 中國(guó)藥理學(xué)通報(bào). 2015(09)
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