目的:本研究擬通過分析EGFR、KRAS突變肺腺癌特有及共有的轉錄調控網(wǎng)絡,篩選EGFR、KRAS突變肺腺癌特有及共有關鍵分子標志物。探討臨床EGFR、KRAS突變肺腺癌轉移、復發(fā)、耐藥及預后不良機制,為EGFR、KRAS突變肺腺癌現(xiàn)有臨床方案的優(yōu)化提供理論依據(jù)。方法:首先,以來自GEO和TCGA數(shù)據(jù)集的EGFR、KRAS突變肺腺癌的基因芯片及高通量測序原始數(shù)據(jù)為研究對象,按照擬定標準處理建立二級數(shù)據(jù)庫。而后,應用差異表達分析、功能富集分析、網(wǎng)絡分析等方法分別建立EGFR、KRAS突變肺腺癌轉錄調控網(wǎng)絡,分析轉移、復發(fā)、耐藥相關基因,應用生存分析法篩選預后相關基因。隨后,應用關聯(lián)分析法建立EGFR、KRAS突變肺腺癌共有轉錄調控網(wǎng)絡,分析兩者轉錄水平的共有關系及相互作用,篩選共有關鍵基因。結果:本研究建立了1個EGFR、KRAS突變肺腺癌轉錄組數(shù)據(jù)庫,包括對應生存數(shù)據(jù)庫9個,其中基因芯片數(shù)據(jù)庫3個,轉錄組數(shù)據(jù)庫6個,共納入肺癌患者1542例。構建并分析EGFR突變肺腺癌轉錄調控圖譜及mRNA子網(wǎng)絡,發(fā)現(xiàn)關鍵基因共492個,其中mRNA 323個、lncRNA 156個、miRNA 13... 

【文章頁數(shù)】：101 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
中文摘要
英文摘要
1 引言
    1.1 問題的提出與研究意義
    1.2 國內外相關研究綜述
    1.3 研究方法
    1.4 數(shù)據(jù)來源與處理
    1.5 論文框架
    1.6 論文的創(chuàng)新點
2 EGFR、KRAS突變肺腺癌組學二級數(shù)據(jù)庫的構建
    2.1 對象與方法
    2.2 結果
    2.3 小結
3 EGFR突變相關肺腺癌轉錄調控圖譜的構建
    3.1 篩選差異表達基因
    3.2 EGFR突變肺腺癌轉錄調控圖譜構建
    3.3 圖譜內關鍵基因的功能富集分析
    3.4 圖譜內關鍵基因的生存分析
    3.5 小結
4 KRAS突變相關肺腺癌轉錄調控圖譜的構建
    4.1 篩選差異表達基因
    4.2 KRAS突變肺腺癌轉錄調控圖譜構建
    4.3 關鍵基因的功能富集分析
    4.4 圖譜內關鍵基因的生存分析
    4.5 小結
5 EGFR、KRAS突變肺腺癌組學關聯(lián)分析及共有轉錄調控圖譜的構建
    5.1 EGFR、KRAS突變肺腺癌關聯(lián)分析
    5.2 EGFR、KRAS突變肺腺癌共有轉錄調控圖譜構建
    5.3 小結
6 結結論與討論
    6.1 結論
    6.2 建議
    6.3 不足與展望
參考文獻
致謝
在學期間承擔/參與的科研課題與研究成果
個人簡歷


【參考文獻】：
期刊論文
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本文編號：3666637