目的:舌鱗狀細(xì)胞癌（TSCC）是頭頸部最常見的惡性腫瘤之一,其分子機(jī)制尚不清楚。挖掘與舌鱗狀細(xì)胞癌（TSCC）密切相關(guān)的hub基因,為揭示TSCC發(fā)病機(jī)制提供理論依據(jù)。方法:從基因表達(dá)綜合數(shù)據(jù)庫（GEO）下載GSE34105數(shù)據(jù),通過WGCNA篩選關(guān)鍵模塊,Cytoscape計算模塊網(wǎng)絡(luò)中節(jié)點(diǎn)的拓?fù)鋮?shù)篩選hub基因,生存分析用于hub基因的外部驗(yàn)證,通過GO和KEGG富集分析和GSEA分析獲取hub基因參與的生物過程。結(jié)果:獲得與TSCC最密切相關(guān)的turquoise模塊（Cor=0.88,P<0.05）。cytoscape篩選獲得2個hub基因分別為CAP1和TMBIM6,是預(yù)后的不良因素,它們的高表達(dá)與患者生存期縮短顯著相關(guān)（P<0.05）。GSEA分析它們高表達(dá)組主要參與了半胱氨酸和蛋氨酸代謝、霍亂弧菌感染、氧化磷酸化、DNA復(fù)制、基底切除修復(fù)、細(xì)胞減數(shù)分裂、蛋白質(zhì)生成、果糖和甘露糖代謝、幽門螺桿菌感染中的上皮細(xì)胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)。結(jié)論:本研究通過構(gòu)建基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)篩選出2個hub基因,可能成為潛在的TSCC基因基因生物標(biāo)志物,影響TSCC的發(fā)生及預(yù)后。 

【文章來源】：口腔醫(yī)學(xué)研究. 2020,36(05)北大核心

【文章頁數(shù)】：5 頁

【部分圖文】：

1a:基于GSE54236表達(dá)數(shù)據(jù)的軟閾值的確定。1b:基因聚類樹狀圖�；赼djacency-based dissimilarity的層次聚類獲得的基因聚類狀圖,樹形圖下方的色塊表示由動態(tài)樹切割方法識別的模塊

圖1 1a:基于GSE54236表達(dá)數(shù)據(jù)的軟閾值的確定。1b:基因聚類樹狀圖�；赼djacency-based dissimilarity的層次聚類獲得的基因聚類狀圖,樹形圖下方的色塊表示由動態(tài)樹切割方法識別的模塊圖3 turquoise模塊基因與TSCC相關(guān)性散點(diǎn)圖

turquoise模塊基因與TSCC相關(guān)性散點(diǎn)圖

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]長鏈非編碼RNAHOTAIR對舌鱗狀細(xì)胞癌增殖及遷移侵襲能力的影響[J]. 代夢瑩,張洋,張照楠,宿偉鵬,張宋安,劉攀,趙化榮.  口腔醫(yī)學(xué)研究. 2018(06)
[2]Hedgehog信號通路效應(yīng)蛋白在舌癌組織中的表達(dá)及意義[J]. 孫國文,張笑佛,李田,胡勤剛,唐恩溢.  口腔醫(yī)學(xué)研究. 2015(04)



本文編號：3621638