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雙胞胎兒童牙菌斑微生態(tài)的組成分析及齲壞牙牙菌斑的耐酸基因功能篩選研究

發(fā)布時間:2022-02-04 16:16
  齲病是人類口腔的常見病、多發(fā)病,其中低齡兒童齲對兒童的口腔健康甚至全身健康都帶來了嚴(yán)重的危害,因此齲病的預(yù)防和治療一直是口腔醫(yī)生研究的重點(diǎn)。而齲機(jī)制的探索能明顯促進(jìn)相關(guān)方面的研究,基于廣為接受的齲機(jī)制理論——四聯(lián)因素論,我們知道宿主、飲食、微生物可通過相互作用,隨著時間的推移誘導(dǎo)齲病的發(fā)生。微生物在這一過程中發(fā)揮著直接且重要的作用,但與宿主、飲食相關(guān)的遺傳和環(huán)境因素對微生物的影響具體有哪些,我們卻知之甚少。此外,基于目前被廣泛認(rèn)可的微生物致齲機(jī)制——生態(tài)菌斑假說,我們知道齲病的發(fā)生通常是由多個菌株相互調(diào)節(jié)完成的,這些微生物均具備一定的特性,如產(chǎn)酸性、耐酸性、代謝糖等,其中耐酸性是幫助微生物在齲環(huán)境中生存并發(fā)揮作用的重要特性。然而,由于培養(yǎng)方法的局限性,目前已知的耐酸基因僅從以變異鏈球菌為主的可培養(yǎng)微生物中獲得,而其他同樣值得被探索研究的、不可培養(yǎng)的齲相關(guān)微生物的耐酸基因卻鮮有研究。因此本研究將以齲病的菌斑微生物為中心,向上探索遺傳和環(huán)境因素對菌斑微生物的影響(第一部分),向下探索菌斑微生物的耐酸基因(第二部分),從而進(jìn)一步增進(jìn)對齲機(jī)制的認(rèn)識,并為齲病的預(yù)防和治療提供新的研究思路。第一部... 

【文章來源】:武漢大學(xué)湖北省211工程院校985工程院校教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:150 頁

【學(xué)位級別】:博士

【部分圖文】:

雙胞胎兒童牙菌斑微生態(tài)的組成分析及齲壞牙牙菌斑的耐酸基因功能篩選研究


圖1.1?PCR產(chǎn)物純化操作步驟??

樣本,顏色圖,貢獻(xiàn)值,交疊


(見表1.1)??2)?OTU?Venn圖分析:在0.97的相似度下,得到每個樣本的OTU個數(shù),然后??用Venn圖展示三組樣本共有和各自特有的OUT數(shù)目。圖1.2顯示三組共有??的OTU數(shù)有169個,齲壞組(Chc2,?OTU=881)的OTU數(shù)多于健康組(Hhcl??和Hhc2,?OTU=820和804),但統(tǒng)計分析發(fā)現(xiàn)無明顯差異(P>0.05)。??臀??圖1.2?OTU?Venn圖分析。不同顏色圖形代表不同的組別,其交疊部分?jǐn)?shù)字為兩組別之間??共有的OTU個數(shù)。同理,多個顏色圖形間的交疊部分?jǐn)?shù)字為多個組別間共有的OTU個數(shù)。??3)?OTU?PCA分析:可根據(jù)樣本聚集和分散的程度判斷樣本間組成是否具有相??似性。圖1.3基于OTU豐度的PCA分析發(fā)現(xiàn)同一組別的樣本并沒有很好的??聚集在一起,初步反映了三組間的樣本組成并無明顯差異。????Chc2????Hhcl?.????Hhc2?_?#?.??2??、?.??I。???????s?..??Q-????-2????■??-4??-2?6?2?4?6??PC1(22.73%)??圖1.3基于OTU豐度的PCA分析。橫坐標(biāo)表示第一主成分,括號中的百分比則表示第一主??成分對樣品差異的貢獻(xiàn)值;縱坐標(biāo)表示第二主成分,括號中的百分比表示第二主成分對樣品??差異的貢獻(xiàn)值。圖中點(diǎn)分別表示各個樣品

豐度


(見表1.1)??2)?OTU?Venn圖分析:在0.97的相似度下,得到每個樣本的OTU個數(shù),然后??用Venn圖展示三組樣本共有和各自特有的OUT數(shù)目。圖1.2顯示三組共有??的OTU數(shù)有169個,齲壞組(Chc2,?OTU=881)的OTU數(shù)多于健康組(Hhcl??和Hhc2,?OTU=820和804),但統(tǒng)計分析發(fā)現(xiàn)無明顯差異(P>0.05)。??臀??圖1.2?OTU?Venn圖分析。不同顏色圖形代表不同的組別,其交疊部分?jǐn)?shù)字為兩組別之間??共有的OTU個數(shù)。同理,多個顏色圖形間的交疊部分?jǐn)?shù)字為多個組別間共有的OTU個數(shù)。??3)?OTU?PCA分析:可根據(jù)樣本聚集和分散的程度判斷樣本間組成是否具有相??似性。圖1.3基于OTU豐度的PCA分析發(fā)現(xiàn)同一組別的樣本并沒有很好的??聚集在一起,初步反映了三組間的樣本組成并無明顯差異。????Chc2????Hhcl?.????Hhc2?_?#?.??2??、?.??I。???????s?..??Q-????-2????■??-4??-2?6?2?4?6??PC1(22.73%)??圖1.3基于OTU豐度的PCA分析。橫坐標(biāo)表示第一主成分,括號中的百分比則表示第一主??成分對樣品差異的貢獻(xiàn)值;縱坐標(biāo)表示第二主成分,括號中的百分比表示第二主成分對樣品??差異的貢獻(xiàn)值。圖中點(diǎn)分別表示各個樣品

【參考文獻(xiàn)】:
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本文編號:3613529

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