在哺乳動物胚胎發(fā)育過程中,合子基因激活作為一個里程碑式的事件,對于早期胚胎發(fā)育具有十分重要的意義。體細胞核移植（Somatic cell nuclear transfer,SCNT）胚胎中通常存在著異常的合子基因激活現(xiàn)象,異常的表觀遺傳修飾可能是造成合子基因激活障礙的重要因素之一。本研究以豬SCNT胚胎和體內(nèi)受精（In vivo fertilization,IVV）胚胎為研究對象,通過單細胞轉(zhuǎn)錄組測序和基因芯片（PCR array）檢測技術(shù)研究了它們早期胚胎發(fā)育過程中的合子基因激活情況以及84種表觀遺傳修飾酶的表達模式。結(jié)果顯示:（1）豬早期IVV胚胎的轉(zhuǎn)錄組呈現(xiàn)動態(tài)的變化模式,4細胞之前以母源因子調(diào)控為主,在4細胞階段合子基因啟動激活轉(zhuǎn)錄。對4種哺乳動物早期胚胎的轉(zhuǎn)錄組/表達譜合并分析表明,合子激活是胚胎發(fā)育過程中一個物種保守的生物學事件,豬、人、小鼠和牛早期胚胎都具有其特有的合子基因激活時間和基因表達模式。四種哺乳動物合子激活時期的差異表達基因在基因功能和通路上的富集大部分具有共通性,同時也有各自特異性,其中豬與牛最為相似;（2）比較豬IVV和SCNT早期胚胎的轉(zhuǎn)錄組圖譜發(fā)現(xiàn),豬早... 

【文章來源】：吉林大學吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

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【學位級別】：博士

【部分圖文】：

RNA測序流程圖

圖 1.2 文庫構(gòu)建原理圖Fig 1.2 The schematic diagram of library constructio測序后，將不同文庫按照有效濃度及目標下機數(shù)據(jù)量的 HiSeq/MiSeq 測序。信息學分析流程流程如圖 1.3：

圖 1.3 生物信息學分析流程圖Fig 1.3 The flow diagram of bioinformatic analysis結(jié)果母細胞及早期胚胎發(fā)育各階段轉(zhuǎn)錄組圖譜的建立取了發(fā)育各階段（MII 期卵母細胞、2 細胞、4 細胞、8 細胞及 IVV 胚胎進行轉(zhuǎn)錄組測序，并對測序結(jié)果進行基因表 R 平臺下的 Deseq2 軟件包）。主成分分析結(jié)果表明，各實復(fù)性良好，證明了數(shù)據(jù)的可靠性（圖 1.4）。

【參考文獻】：
期刊論文
[1]小鼠2細胞胚胎基因表達譜分析[J]. 呂志一,孫健紅,徐薇,蘇峰,權(quán)富生,華松,張涌.  西北農(nóng)業(yè)學報. 2010(06)
[2]哺乳動物胚胎基因組表達起始的調(diào)控[J]. 陳雯,陳杰,劉紅林.  畜牧與獸醫(yī). 2003(11)



本文編號：3578460