菠蘿（Ananas comosus（L.）Merr.）屬于鳳梨科（Bromeliaceae）,是世界上聞名的熱帶和亞熱帶水果之一,也是我國(guó)重要的經(jīng)濟(jì)作物。菠蘿果實(shí)含糖量是決定菠蘿品質(zhì)和產(chǎn)量的重要因素之一。果實(shí)中糖的累積主要通過(guò)碳水化合物代謝,光合同化產(chǎn)物主要以蔗糖的形式運(yùn)輸?shù)綆?kù)器官,給庫(kù)器官生長(zhǎng)發(fā)育提供能量。糖外排轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白（sugars will eventually be exported transporters,SWEETs）是一組最近確定的植物糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,在不同的生理過(guò)程中發(fā)揮重要作用。然而,目前關(guān)于這個(gè)基因家族的信息在菠蘿中很少涉及。最近發(fā)布的菠蘿基因組為調(diào)查菠蘿SWEET基因在全基因組水平上的組織和進(jìn)化特征提供了一個(gè)很好的機(jī)會(huì)。本研究利用比較基因組學(xué)鑒定出菠蘿基因家族成員,利用一系列的生物信息學(xué)方法提供了菠蘿SWEET基因的系統(tǒng)描述,利用轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)（RNAseq）分析不同基因的表達(dá)模式,鑒定了在菠蘿果實(shí)發(fā)育方面可能起作用的SWEET基因,以期為菠蘿的分子育種提供依據(jù)。主要研究結(jié)果如下:（1）以擬南芥SWEET基因?yàn)閰⒖?通過(guò)比較基因組學(xué)確定了SWEET基因在兩個(gè)菠蘿栽培品種... 

【文章來(lái)源】：山東農(nóng)業(yè)大學(xué)山東省

【文章頁(yè)數(shù)】：59 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
中文摘要
Abstract
1 前言
    1.1 菠蘿的概述
    1.2 糖在植物中的作用
    1.3 植物SWEET蛋白的結(jié)構(gòu)與功能
        1.3.1 SWEET蛋白的結(jié)構(gòu)特征
        1.3.2 SWEET蛋白的生物學(xué)功能
    1.4 植物SWEET基因家族的進(jìn)化分析
    1.5 本研究的目的與意義
    1.6 本文的主要研究?jī)?nèi)容
    1.7 本章小結(jié)
2 材料與方法
    2.1 材料概況
    2.2 SWEET基因家族的數(shù)據(jù)檢索和預(yù)測(cè)
    2.3 SWEET基因家族的生物信息學(xué)分析方法
        2.3.1 SWEET基因家族的跨膜結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)
        2.3.2 SWEET基因家族的系統(tǒng)進(jìn)化樹的構(gòu)建
        2.3.3 SWEET基因家族的保守基序分析方法
        2.3.4 SWEET基因家族的基因結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
        2.3.5 SWEET基因家族的染色體定位與重復(fù)事件分析
        2.3.6 計(jì)算Ka/Ks值
        2.3.7 SWEET基因家族的表達(dá)模式分析
    2.4 軟件與算法
    2.5 本章小結(jié)
3 結(jié)果與分析
    3.1 SWEET基因家族的鑒定和特征分析
    3.2 SWEET基因家族的系統(tǒng)演化
    3.3 SWEET基因家族的染色體定位和重復(fù)事件
    3.4 菠蘿SWEET基因家族的選擇壓力
    3.5 SWEET基因家族的多序列聯(lián)配和保守結(jié)構(gòu)域特征
    3.6 SWEET基因家族的結(jié)構(gòu)
    3.7 SWEET基因家族在發(fā)育果實(shí)中的表達(dá)模式
    3.8 討論與小結(jié)
4 結(jié)論與展望
參考文獻(xiàn)
致謝
攻讀學(xué)位期間發(fā)表論文情況


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]雷蒙德氏棉SWEET基因家族的全基因組鑒定和進(jìn)化分析[J]. 陳慧敏,李威,馬雄風(fēng),裴小雨,劉艷改,賀昆侖,張飛,張文生,王振玉,楊代剛,胡守林.  中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào). 2017(25)
[2]植物SWEET基因家族結(jié)構(gòu)、功能及調(diào)控研究進(jìn)展[J]. 胡麗萍,張峰,徐惠,劉光敏,王亞欽,何洪巨.  生物技術(shù)通報(bào). 2017(04)
[3]SWEET轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白家族的發(fā)現(xiàn)、結(jié)構(gòu)及功能研究進(jìn)展[J]. 孫文杰,左開井.  分子植物育種. 2016(04)
[4]擬南芥、水稻和番茄SW EET/MtN3/saliva基因家族的分析[J]. 韓佳軒,姜晶.  分子植物育種. 2015(03)
[5]SWEET蛋白家族研究進(jìn)展[J]. 玄元虎,朱毅勇,胡一兵.  中國(guó)科學(xué):生命科學(xué). 2014(07)
[6]Rice MtN3/saliva/SWEET gene family: Evolution,expression profiling, and sugar transport[J]. Meng Yuan,Junwei Zhao,Renyan Huang,Xianghua Li,Jinghua Xiao,Shiping Wang.  Journal of Integrative Plant Biology. 2014(06)



本文編號(hào)：3546687