目的通過(guò)生物信息學(xué)技術(shù)分析慢性阻塞性肺疾病（COPD）患者肺泡巨噬細(xì)胞（AM）差異表達(dá)基因（DEG）及其在COPD發(fā)病中的可能作用。方法下載基因表達(dá)數(shù)據(jù)集（GEO）數(shù)據(jù)庫(kù)中COPD患者AM研究芯片和測(cè)序數(shù)據(jù),應(yīng)用R軟件中l(wèi)imma和Degseq2包獲取差異表達(dá)基因,并通過(guò)基因本體（GO）富集分析、京都基因與基因組百科全書（KEGG）富集分析、蛋白質(zhì)相互作用分析（PPI）及關(guān)鍵基因（hub基因）分析,預(yù)測(cè)DEG可能參與的分子生物學(xué)機(jī)制。結(jié)果通過(guò)整合3個(gè)數(shù)據(jù)集,共獲得AM的43個(gè)DEG,功能預(yù)測(cè)發(fā)現(xiàn)43個(gè)DEG主要與趨化因子、細(xì)胞因子、補(bǔ)體、細(xì)胞色素P450等相關(guān),其主要涉及顯著低表達(dá)的CXC趨化因子配體9（CXCL9）、 CXCL11等及顯著高表達(dá)的細(xì)胞色素P450家族1亞家族B成員1（CYP1B1）。結(jié)論COPD患者AM的DEG與免疫和炎癥的分子機(jī)制相關(guān),可能參與COPD慢性炎癥的發(fā)病機(jī)制。 

【文章來(lái)源】：細(xì)胞與分子免疫學(xué)雜志. 2020,36(11)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】：6 頁(yè)

【部分圖文】：

差異基因蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)分析

hub基因分析

差異基因KEGG富集分析

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]肺泡巨噬細(xì)胞TLR4/MyD88信號(hào)通路參與并介導(dǎo)了機(jī)械通氣所致的肺損傷[J]. 黃翠源,潘靈輝,林飛,錢衛(wèi),李瑋.  細(xì)胞與分子免疫學(xué)雜志. 2015(02)



本文編號(hào)：3520113