生長素受體SlTIR1/AFBs家族基因在番茄生長與發(fā)育中的調控機制研究
發(fā)布時間:2021-11-22 10:55
生長素作為一種重要的植物激素,參與植物生長和發(fā)育諸多過程以及調控許多生理反應。生長素通過介導其受體TIR1/AFB與轉錄抑制子Aux/IAA蛋白直接相互作用,促使Aux/IAA蛋白降解,將下游的轉錄因子ARF去抑制化,從而激活生長素信號通路,使得植物最終表現(xiàn)出生理反應。植物對生長素的響應是一個極其復雜的過程,存在著嚴密的調控機制。因此,研究生長素的作用機制對深入認識植物生長發(fā)育的生理過程有著重要的意義。番茄是一種重要經(jīng)濟作物,也是研究一些重要性狀,如:復葉、聚傘花序以及果實發(fā)育、成熟的模式植物。TIR1/AFB蛋白作為生長素受體,處于生長素信號通路中關鍵位置,研究生長素受體基因功能至關重要。但是生長素受體及信號轉導對番茄復葉及花器官發(fā)育、果實形成的調控機制仍缺乏了解。本論文以番茄為研究材料,通過生物信息學、遺傳轉化、組織切片法、生理生化、分子生物學等方法分析了SlTIR1/AFBs基因家族成員的結構、表達、蛋白互作特性及其功能,以期揭示生長素受體SlTIR1/AFBs同源基因家族成員對番茄生長、發(fā)育調控功能的差異性以及在生長素信號中調控方式,同時闡明SlmiR393在轉錄后介導生長素受...
【文章來源】:重慶大學重慶市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:131 頁
【學位級別】:博士
【部分圖文】:
生長素信號轉導的模式
IN (CUL1)、RING-H2 鋅指蛋白 R接酶所介導的泛素化-蛋白水解體途antner and Estelle, 2009)。盡管擬AFB2, AFB3, AFB4 與 AFB5 已被需要進一步研究。Tan 等 (Tan et 構,該結構呈現(xiàn)蘑菇形狀 (圖 1.2)。位置,由 TIR1的 C 端 LRR結構域口。蘑菇莖形狀則為 TIR1 的 N 端素作為分子黏合劑,可促進 TIR1 /IAA 與 TIR1 之間結合并不能使得 ,TIR1 跟 Aux/IAA 互作僅在生長的降解決定子序列的晶體結構被解蛋白結構被全部解析,將會揭示生
圖 2.1 SlTIR1/AFBs 家族基因組的結構(A) 圖片由在線軟件 GSDS所生成。(B) 番茄 TIR1/AFB家族成員的基因結構。Fig 2.1 Gene structure of the four tomato SlTIR1/AFBs genes(A) The figure was produced using GSDS software. (B) Structural features of the tomatoSlTIR1/AFBs family members.對 Sl-TIR1/AFBs 的氨基酸序列比對發(fā)現(xiàn),番茄 Sl-TIR1A/B 都與擬IR1 具有高度的同源,相似性在 80%-89%;Sl-AFB4 與擬南芥 AFB4/AFB為 66-68%; Sl-AFB6與擬南芥 TIR1/AFB 家族成員之間的相似性略低,56%;但是,Sl-AFB6卻與楊樹 PtAFB6氨基酸序列相似性為 84% (表 2.4)確番茄與其他物種的 TIR1/AFB 家族基因的進化關系,我們利用 clustalX Mega 5.0軟件構建了系統(tǒng)進化樹。結果表明,番茄 Sl-TIR1/AFB家族基個亞家族。Sl-TIR1A/B 與擬南芥 TIR1 同屬于 TIR1/AFB1 亞家族;Sl-A南芥 AFB4、AFB5 歸屬為 AFB4 亞家族;Sl-AFB6 與 PtAFB6 歸屬于 A族,該亞家族不含有擬南芥 TIR1/AFB家族成員 (圖 2.2)。
本文編號:3511546
【文章來源】:重慶大學重慶市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
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【學位級別】:博士
【部分圖文】:
生長素信號轉導的模式
IN (CUL1)、RING-H2 鋅指蛋白 R接酶所介導的泛素化-蛋白水解體途antner and Estelle, 2009)。盡管擬AFB2, AFB3, AFB4 與 AFB5 已被需要進一步研究。Tan 等 (Tan et 構,該結構呈現(xiàn)蘑菇形狀 (圖 1.2)。位置,由 TIR1的 C 端 LRR結構域口。蘑菇莖形狀則為 TIR1 的 N 端素作為分子黏合劑,可促進 TIR1 /IAA 與 TIR1 之間結合并不能使得 ,TIR1 跟 Aux/IAA 互作僅在生長的降解決定子序列的晶體結構被解蛋白結構被全部解析,將會揭示生
圖 2.1 SlTIR1/AFBs 家族基因組的結構(A) 圖片由在線軟件 GSDS所生成。(B) 番茄 TIR1/AFB家族成員的基因結構。Fig 2.1 Gene structure of the four tomato SlTIR1/AFBs genes(A) The figure was produced using GSDS software. (B) Structural features of the tomatoSlTIR1/AFBs family members.對 Sl-TIR1/AFBs 的氨基酸序列比對發(fā)現(xiàn),番茄 Sl-TIR1A/B 都與擬IR1 具有高度的同源,相似性在 80%-89%;Sl-AFB4 與擬南芥 AFB4/AFB為 66-68%; Sl-AFB6與擬南芥 TIR1/AFB 家族成員之間的相似性略低,56%;但是,Sl-AFB6卻與楊樹 PtAFB6氨基酸序列相似性為 84% (表 2.4)確番茄與其他物種的 TIR1/AFB 家族基因的進化關系,我們利用 clustalX Mega 5.0軟件構建了系統(tǒng)進化樹。結果表明,番茄 Sl-TIR1/AFB家族基個亞家族。Sl-TIR1A/B 與擬南芥 TIR1 同屬于 TIR1/AFB1 亞家族;Sl-A南芥 AFB4、AFB5 歸屬為 AFB4 亞家族;Sl-AFB6 與 PtAFB6 歸屬于 A族,該亞家族不含有擬南芥 TIR1/AFB家族成員 (圖 2.2)。
本文編號:3511546
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