目的通過生物信息學(xué)方法分析基因AL360181.1在結(jié)直腸癌進(jìn)展及預(yù)后中的作用,并進(jìn)一步預(yù)測可能的分子機(jī)制。方法從TCGA數(shù)據(jù)庫下載結(jié)直腸癌基因表達(dá)數(shù)據(jù)及臨床數(shù)據(jù),應(yīng)用Perl及R軟件對數(shù)據(jù)整理后篩選出差異表達(dá)的基因,進(jìn)一步對差異基因批量化行生存、獨(dú)立預(yù)后及臨床病理相關(guān)性分析,選取相關(guān)性最強(qiáng)的差異基因作為目的基因;分析目的基因的表達(dá)與結(jié)直腸癌不同臨床病理特征的相關(guān)性及對患者預(yù)后的影響;采用R軟件對不同的臨床病理特征行獨(dú)立預(yù)后分析;分析目的基因以及不同臨床病理與患者生存預(yù)后的關(guān)系;應(yīng)用GSEA對目的基因行KEGG通路富集分析并利用R軟件分析目的基因與潛在靶基因的相關(guān)性,預(yù)測目的基因調(diào)控結(jié)直腸癌進(jìn)展及預(yù)后可能的機(jī)制。結(jié)果基因AL360181.1在結(jié)直腸癌組織中顯著高表達(dá)（P<0.01）;AL360181.1與結(jié)直腸癌的分級、TNM分期具有相關(guān)性（P<0.05）;基因AL360181.1、年齡、腫瘤分級、TNM分期與患者預(yù)后相關(guān)（P<0.05）,且基因AL360181.1及年齡可作為評價(jià)患者預(yù)后的獨(dú)立風(fēng)險(xiǎn)因子;基因AL360181.1的表達(dá)水平、患者年齡、分級及TNM分期與... 

【文章來源】：西安交通大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2020,41(05)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：7 頁

【部分圖文】：

TCGA數(shù)據(jù)庫中基因AL360181.1在結(jié)直腸癌中的差異表達(dá)

分析不同臨床病理特征與基因AL360181.1表達(dá)之間的關(guān)系,結(jié)果顯示,基因AL360181.1的表達(dá)與患者腫瘤分級、TNM分期呈正相關(guān)(P<0.05),與患者年齡、性別無關(guān)(P>0.05,圖2)。推測基因AL360181.1可作為調(diào)節(jié)結(jié)直腸癌進(jìn)展并影響患者預(yù)后的潛在靶標(biāo)。2.4 臨床病理特征獨(dú)立預(yù)后分析情況

對各臨床病理特征進(jìn)行單因素獨(dú)立預(yù)后分析的結(jié)果顯示,基因AL360181.1、年齡、分級及TNM分期與患者預(yù)后相關(guān)(P<0.05),患者性別與預(yù)后無關(guān)(P=0.653,圖3A);對各臨床病理特征的多因素獨(dú)立預(yù)后分析結(jié)果顯示,基因AL360181.1、年齡可作為評價(jià)患者預(yù)后的獨(dú)立危險(xiǎn)因子(圖3B)。以上結(jié)果提示,基因AL360181.1可作為調(diào)節(jié)結(jié)直腸癌進(jìn)展及預(yù)后的潛在靶標(biāo)。2.5 生存分析結(jié)果


本文編號：3508013