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合并XCI與印記效應(yīng)的X染色體致病基因定位方法研究

發(fā)布時(shí)間:2021-11-09 17:09
  背景:X染色體在很多伴性遺傳病中有著非常重要的作用。然而,人們目前發(fā)現(xiàn)的X染色體上與疾病相關(guān)聯(lián)的單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)卻很少。與常染色體相比,定位X染色體上的疾病位點(diǎn)顯得更加困難。究其原因,一方面是由于男性和女性X染色體的數(shù)量不同;另一方面,為了防止女性的基因表達(dá)量是男性的2倍,女性個(gè)體體內(nèi)細(xì)胞會(huì)選擇其中一條X染色體失活以達(dá)到劑量補(bǔ)償?shù)淖饔谩S腥N類型的失活機(jī)制:逃逸失活、隨機(jī)失活和偏倚失活。此外,印記基因?qū)φ5纳L發(fā)育起著至關(guān)重要的作用,而變異的遺傳印記則會(huì)影響個(gè)體的生長發(fā)育,導(dǎo)致各種疾病。研究發(fā)現(xiàn)人類中某些復(fù)雜性狀也與X染色體上的印記基因相關(guān)聯(lián)。目前,人們已經(jīng)提出一些適用于定位X染色體上致病位點(diǎn)的關(guān)聯(lián)分析方法,這些方法考慮了X染色體失活。然而,沒有一種方法合并了印記效應(yīng)的信息。目的:基于病例對(duì)照數(shù)據(jù),在不需要指定遺傳模型的前提下,我們提出一種可以合并X染色體失活和印記效應(yīng)的定位疾病位點(diǎn)的方法。方法:假設(shè)男性和女性的致病基因相同,將數(shù)據(jù)按照性別分層,分別構(gòu)造檢驗(yàn)統(tǒng)計(jì)量,然后將這些檢驗(yàn)統(tǒng)計(jì)量按照樣本量加權(quán)合并得到最終的檢驗(yàn)統(tǒng)計(jì)量ZXCII。通過大量的計(jì)算機(jī)模擬研究比較新提出的ZXCII方... 

【文章來源】:南方醫(yī)科大學(xué)廣東省

【文章頁數(shù)】:127 頁

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

合并XCI與印記效應(yīng)的X染色體致病基因定位方法研究


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樣本量,偏倚,失活,效應(yīng)


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偏倚,失活,樣本,效應(yīng)


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【參考文獻(xiàn)】:
博士論文
[1]X染色體失活的統(tǒng)計(jì)度量及合并X染色體失活的關(guān)聯(lián)分析研究[D]. 汪鵬.南方醫(yī)科大學(xué) 2018

碩士論文
[1]基于三聯(lián)體家庭數(shù)據(jù)X染色體偏倚失活的統(tǒng)計(jì)度量研究[D]. 徐思琦.南方醫(yī)科大學(xué) 2019
[2]X染色體印記效應(yīng)檢驗(yàn)及合并X染色體失活與印記效應(yīng)的關(guān)聯(lián)分析研究[D]. 鄒綺蕾.南方醫(yī)科大學(xué) 2017



本文編號(hào):3485744

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