原發(fā)性開角型青光眼患者ABCA1基因編碼區(qū)稀有變異的篩查與研究
發(fā)布時(shí)間:2021-11-05 06:10
目的:原發(fā)性開角型青光眼(POAG)是全球重要的致盲性眼病,ABCA1基因是POAG的易感基因之一。本研究通過對(duì)POAG患者ABCA1基因編碼區(qū)變異進(jìn)行檢測(cè)與分析,篩選ABCA1基因稀有非同義變異,探討其在POAG患者中的分布情況。方法:自2017年3月到2018年3月,共招募到散發(fā)型POAG患者398例和健康個(gè)體198例,采用全外顯子測(cè)序(WES)技術(shù)對(duì)ABCA1基因50個(gè)外顯子區(qū)進(jìn)行測(cè)序,對(duì)在POAG患者中篩選出來的ABCA1基因稀有變異位點(diǎn)進(jìn)行Sanger測(cè)序驗(yàn)證,并在健康人群中進(jìn)行頻率驗(yàn)證。對(duì)這些ABCA1基因稀有變異進(jìn)行生物信息學(xué)分析與統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,并根據(jù)美國(guó)醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)與基因組學(xué)學(xué)會(huì)(ACMG)遺傳變異分類標(biāo)準(zhǔn)與指南對(duì)稀有變異進(jìn)行分類。結(jié)果:1.ABCA1基因WES結(jié)果:在398例POAG患者中,共27例檢出ABCA1基因稀有變異(MAF<0.01),共21個(gè)稀有變異位點(diǎn),包括19個(gè)錯(cuò)義變異、1個(gè)無義變異(c.2725C>T(p.Arg909X))以及1個(gè)移碼變異(c.15071508insGAGGT(p.Glu503GlyfsX7)),均為雜...
【文章來源】:成都中醫(yī)藥大學(xué)四川省
【文章頁(yè)數(shù)】:72 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
ABCA1蛋白合成HDL過程示意圖
圖 2 ABCA1 蛋白結(jié)構(gòu)示意圖Figure2 The structure ofABCA1 proteinD1 和 ECD2 為胞外域;NBD1 和 NBD2 為核苷酸結(jié)合域;TMD1 和 TMD2 為R1 和 R2 為兩個(gè)小的調(diào)節(jié)域。ECD1 and ECD2 are extracellular domains. NBD1 and NBD2 are nucleotids. TMD1 and TMD2 are transmembrane domains. R1 and R2 are two R domains.CA1 基因稀有變異與 POAG 的關(guān)系尚未見報(bào)道OAG 作為眼科常見的復(fù)雜疾病,由遺傳因素和環(huán)境因素共同決定 研究基于常見疾病-常見變異(common disease-common variants)復(fù)雜疾病相關(guān)聯(lián)的常見變異(最小等位基因頻率 MAF>0.05)方面成就,但同時(shí)也發(fā)現(xiàn)常見變異只能解釋常見疾病遺傳度中很小的一較為嚴(yán)重的遺傳度的缺失[22]。近年來,隨著第二代測(cè)序(the next gecing , NGS)技術(shù)的發(fā)展,對(duì)全外顯子甚至整個(gè)基因組的測(cè)序研究
圖 1-1 POAG 患者與健康者臨床特征 1-1 The clinical characteristics of POAG patients and healthy眼底(B)與健康者(A)相比,眼底發(fā)生典型病變;POA(C)相比,杯盤比明顯增高;POAG 患者視野(F)與健康 of the POAG patient (B) has a typical lesion compared w(A); the cup-to-disk ratio (D) of the POAG patient is significany people (C); the vision of the POAG patient (F ) is significision ofhealthypeople (E).與儀器試劑組 DNA 提取試劑盒(北京天根生化科技有限公司)n V6 試劑盒(安捷倫科技有限公司)、無水乙醇(成異丙醇(成都欣正通化工有限公司)、引物(上海生Taq Master Mix(康為世紀(jì)生物有限公司)、DM2000
本文編號(hào):3477238
【文章來源】:成都中醫(yī)藥大學(xué)四川省
【文章頁(yè)數(shù)】:72 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
ABCA1蛋白合成HDL過程示意圖
圖 2 ABCA1 蛋白結(jié)構(gòu)示意圖Figure2 The structure ofABCA1 proteinD1 和 ECD2 為胞外域;NBD1 和 NBD2 為核苷酸結(jié)合域;TMD1 和 TMD2 為R1 和 R2 為兩個(gè)小的調(diào)節(jié)域。ECD1 and ECD2 are extracellular domains. NBD1 and NBD2 are nucleotids. TMD1 and TMD2 are transmembrane domains. R1 and R2 are two R domains.CA1 基因稀有變異與 POAG 的關(guān)系尚未見報(bào)道OAG 作為眼科常見的復(fù)雜疾病,由遺傳因素和環(huán)境因素共同決定 研究基于常見疾病-常見變異(common disease-common variants)復(fù)雜疾病相關(guān)聯(lián)的常見變異(最小等位基因頻率 MAF>0.05)方面成就,但同時(shí)也發(fā)現(xiàn)常見變異只能解釋常見疾病遺傳度中很小的一較為嚴(yán)重的遺傳度的缺失[22]。近年來,隨著第二代測(cè)序(the next gecing , NGS)技術(shù)的發(fā)展,對(duì)全外顯子甚至整個(gè)基因組的測(cè)序研究
圖 1-1 POAG 患者與健康者臨床特征 1-1 The clinical characteristics of POAG patients and healthy眼底(B)與健康者(A)相比,眼底發(fā)生典型病變;POA(C)相比,杯盤比明顯增高;POAG 患者視野(F)與健康 of the POAG patient (B) has a typical lesion compared w(A); the cup-to-disk ratio (D) of the POAG patient is significany people (C); the vision of the POAG patient (F ) is significision ofhealthypeople (E).與儀器試劑組 DNA 提取試劑盒(北京天根生化科技有限公司)n V6 試劑盒(安捷倫科技有限公司)、無水乙醇(成異丙醇(成都欣正通化工有限公司)、引物(上海生Taq Master Mix(康為世紀(jì)生物有限公司)、DM2000
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