菊花（Chrysanthemum×morifolium Ramat）是世界上重要的觀賞植物之一,具備觀賞、食用、藥用和茶用等多種價值。作為一種起源于我國的重要花卉,菊花變異之豐富在栽培植物中是比較罕見的,而且是在只有1600多年的栽培歷史中發(fā)生如此巨大變化,所以這種變異起源的問題一直是菊花研究者普遍關注的一個重要命題。DNA甲基化是研究相對較多的表觀遺傳修飾之一,涉及許多生物學過程,包括轉座子沉默和激活、基因印記和染色體失活,其在調控植物的生長發(fā)育方面有著重要的作用。DNA甲基化與菊花各種變異性狀的形成是否發(fā)揮作用,是需要探討的課題。而對菊花DNA甲基化修飾相關酶基因進行鑒定與分析是解析這一問題的重要基礎。本研究以菊花‘金背大紅’、‘野菊（菊花腦,Chrysanthemum×nankingense）’和MET1干涉的菊花‘紫精靈’為實驗材料。對‘金背大紅’和‘菊花腦’的測序數據進行生物信息學分析,初步鑒定了菊花DNA甲基轉移酶和去甲基化酶基因,熒光定量PCR技術檢測了其在不同組織和不同菊花品種中的表達量。此外,對MET1-_RNAi材料進行轉錄組測序,從轉錄水平上揭... 

【文章來源】：河南大學河南省

【文章頁數】：75 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
1 緒論
    1.1 菊花
    1.2 表觀遺傳學
    1.3 植物DNA甲基化
        1.3.1 DNA甲基化的特點
        1.3.2 DNA甲基化的類型
        1.3.3 DNA去甲基化
        1.3.4 主要的DNA甲基轉移酶和去甲基化酶
    1.4 DNA甲基化的研究
        1.4.1 DNA甲基化對植物表型和種子萌發(fā)的影響
        1.4.2 DNA甲基化與春化作用
        1.4.3 DNA甲基化對植物基因組防御的作用
        1.4.4 DNA甲基化參與植物逆境脅迫的調控
    1.5 高通量測序技術
    1.6 轉錄組測序技術發(fā)展
    1.7 本研究目的及研究內容
2 植物材料和實驗方法
    2.1 植物材料
        2.1.1 三代測序材料及實時熒光定量PCR所需的材料
        2.1.2 轉錄組測序所需的材料
    2.2 實驗方法
        2.2.2 DNA甲基化相關酶基因鑒定的實驗方法
        2.2.3 MET1-_(RNAi)材料轉錄組分析的實驗方法
3 結果分析
    3.1 菊花DNA甲基轉移酶和去甲基化酶基因的鑒定及表達分析
        3.1.1 DNA甲基轉移酶和去甲基酶基因的理化性質分析和保守結構域分析
        3.1.2 DNA甲基轉移酶和去甲基化酶基因的系統(tǒng)發(fā)育樹分析
        3.1.3 DNA甲基轉移酶和去甲基化酶基因在“金背大紅”的不同組織及不同品種的表達分析
        3.1.4 DNA甲基轉移酶和去甲基化酶基因在“菊花腦”不同組織的表達分析
    3.2 MET1-_(RNAi)材料轉錄組分析
        3.2.1 轉錄組測序產量分析
        3.2.2 基因注釋與功能分類
        3.2.3 差異表達基因分析
        3.2.4 MET1-_(RNAi)材料與對照組差異表達基因qRT-PCR結果驗證
4 討論
    4.1 菊花DNA甲基轉移酶和去甲基化酶基因鑒定及系統(tǒng)發(fā)育樹分析
    4.2 菊花DNA甲基化相關酶基因表達分析
    4.3 MET1-_(RNAi)材料轉錄組分析
5 結論
參考文獻
致謝
發(fā)表論文目錄
附錄


【參考文獻】：
期刊論文
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碩士論文
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