小黑楊轉(zhuǎn)錄因子PsnMYB108基因耐鹽脅迫功能分析
發(fā)布時間:2021-10-27 10:47
MYB轉(zhuǎn)錄因子家族作為植物最大的轉(zhuǎn)錄因子家族之一,參與植物的整個生長發(fā)育過程,在植物應答外界逆境脅迫中非常重要。本研究以小黑楊(Populus simsonii×Pnigra)為材料,從本實驗室前期篩選出的耐鹽基因中,選擇PsnMYB108基因作為研究對象進行基因功能分析。結(jié)果如下:從小黑楊葉片中克隆出954bp的PsnMYB108基因的cDNA片段,其編碼的蛋白含有317個氨基酸,屬于不穩(wěn)定的親水蛋白,不存在信號肽,不具跨膜能力,含兩個MYB家族保守結(jié)構(gòu)域。系統(tǒng)進化樹表明,小黑楊PsnMYB108蛋白與毛果楊MYB108蛋白及胡楊、榴蓮、茶花、銀白楊、向日葵的MYB108-like蛋白具有較近的遺傳距離。PsnMYB108啟動子中含有與植物抗逆相關(guān)的順式作用元件。亞細胞定位結(jié)果表明,PsnMYB108蛋白定位于細胞核中。PsnMYB108基因表達具有組織特異性,并受脅迫誘導表達。PsnMYB108基因在根中的相對表達水平明顯比在莖和葉中表達水平高。在鹽脅迫下,PsnMYB108基因表現(xiàn)上調(diào)表達。表明PsnMYB108基因可能與植物應答高鹽脅迫相關(guān)。將PsnMYB108基因 ORF 分...
【文章來源】:東北林業(yè)大學黑龍江省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:70 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
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【參考文獻】:
期刊論文
[1]鹽脅迫下根瘤共生豌豆植株對外源鈣的生理響應[J]. 馬紹英,馬蕾,徐勃,楊寧,張旭輝,柴強,李勝. 應用生態(tài)學報. 2020(03)
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博士論文
[1]棉花R2R3-MYB基因家族海陸種間序列變異及與纖維性狀的相關(guān)性分析[D]. 王諾菡.西北農(nóng)林科技大學 2019
[2]玫瑰MYB轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控類黃酮介導的逆境響應機制研究[D]. 申玉曉.華中農(nóng)業(yè)大學 2019
[3]棉花基因GhWRKY6-like和GhMYB108-like在非生物逆境方面的功能解析[D]. ABID ULLAH.華中農(nóng)業(yè)大學 2018
[4]毛竹生殖器官發(fā)育相關(guān)miRNA挖掘與miR159-GAMYB途徑對花藥發(fā)育調(diào)控研究[D]. 侯丹.中國林業(yè)科學研究院 2018
[5]植物激素脫落酸的受體蛋白PYL8和PYL9通過結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子MYB家族成員調(diào)控擬南芥的側(cè)根生長[D]. 邢璐.中國科學技術(shù)大學 2016
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碩士論文
[1]擬南芥MYB6調(diào)控莖頂端生長點大小的機制研究[D]. 劉祥政.山東大學 2019
[2]丹參SmMYB36基因?qū)祁惡捅奖榇x途徑調(diào)控的研究[D]. 趙英.西北農(nóng)林科技大學 2019
[3]小麥轉(zhuǎn)錄因子TaMYB108基因的克隆、表達分析及耐鹽功能的研究[D]. 王睿斌.華中科技大學 2017
[4]84K楊轉(zhuǎn)錄因子NAC57基因耐鹽脅迫功能分析[D]. 李晰妍.東北林業(yè)大學 2017
[5]桑樹MYB轉(zhuǎn)錄因子家族的生物信息學及黃酮合成相關(guān)基因的表達分析[D]. 陳泓宇.西南大學 2015
本文編號:3461447
【文章來源】:東北林業(yè)大學黑龍江省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:70 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2-2小黑楊PwMZWfW基因的全長??Fig.2-2?Full?length?oiPsnMYB108?gene??
2小黑楊PsnMVTWJOS基因的克隆及表達分析??謂??圖2-1小黑楊葉片總RNA瓊脂糖凝膠電泳檢測??Fig.2-1?Total?RNA?agarose?electrophoresis?detection?of?Populus?simonii^RnigJ-a?leave??2.?3.?2小黑楊Psa?/WKS:ZOS基因的克隆??將小黑楊RNA反轉(zhuǎn)錄得到的cDNA稀釋10倍后作為模板,以PotMFB/似-F、??乃《從757仰-R為引物進行PCR擴增,擴增出一條長度為954bp的DNA片段(圖??2-2)。??tvterker?PsnMYB108??1000bp???750bp?——?^4bP??5〇〇bp?—??250bp?????bp?1??H??圖2-2小黑楊PwMZWfW基因的全長??Fig.2-2?Full?length?oiPsnMYB108?gene??將小黑楊徹基因與pMD19-T載體相連接,并導入大腸桿菌,挑取??5個白色斑點,搖菌后進行PCR反應,電泳檢測后仍能在凝膠成像儀下觀察到??954bp長度片段,選擇目的條帶正確菌液送至生工測序,結(jié)果比對正確,表明??尸MM7570S基因與pMD19-T載體連接成功(圖2-3)。保留測序成功菌液備用。??20??
東北林業(yè)大學碩士論文??M?1?2?3?4?5??2000hp???10OObp???7s〇bp??????250bp?一??1〇〇bp?-??圖2-3小黑楊/^?Mra7似基因與pMD19-T載體連接菌液PCR??Fig.2-3?PCR?of?PsnMYB108?gene?linked?to?T?vector??2.?3.?3小黑楊PS/7/WY8彳OS基因生物信息學分析??2.?3.?3.?1小黑楊PsnMYB108蛋白基本理化性質(zhì)分析及二級結(jié)構(gòu)預測??從小黑楊cDNA模板中克隆獲得954bp的基因cDNA片段,編??碼317個氨基酸,含20種氨基酸(圖2-4),具完整的開放閱讀框。PsnMYB108??蛋白的化學式SC1569H24mN4550?496S16,等電點(PI)為5.93,不穩(wěn)定系數(shù)為49.31,??屬于不穩(wěn)定蛋白。??121?10.1??藝?1〇-?6.2??W?3-5.6?6.3?s?5'9?5.3??4fl?,?_?57?5?5??菡?I?I?a?■?^4-1?3?24'1?44??3.S44??5?llllldllmH.illiii??嘗11^550。√m3昱111沒f蘭蘭5??圖2-4?PsnMYB108蛋白編碼氨基酸含量??Fig.2-4?Secondary?structure?of?PsnMYB108?protein??利用在線軟件SOPMA對小黑楊PsnMYB108蛋白的氨基酸序列進行二級結(jié)??構(gòu)預測,結(jié)果表明該蛋白主要由無規(guī)則卷曲(53.77%)、a-螺旋(39.62%)、??延伸鏈(4.40%)、B-折疊(2.20%)組成(圖?2-5,表?2-
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[6]植物對鹽脅迫的響應及耐鹽調(diào)控的研究進展[J]. 王康君,樊繼偉,陳鳳,李強,孫中偉,郭明明,張廣旭,鄭國良. 江西農(nóng)業(yè)學報. 2018(12)
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博士論文
[1]棉花R2R3-MYB基因家族海陸種間序列變異及與纖維性狀的相關(guān)性分析[D]. 王諾菡.西北農(nóng)林科技大學 2019
[2]玫瑰MYB轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控類黃酮介導的逆境響應機制研究[D]. 申玉曉.華中農(nóng)業(yè)大學 2019
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[4]毛竹生殖器官發(fā)育相關(guān)miRNA挖掘與miR159-GAMYB途徑對花藥發(fā)育調(diào)控研究[D]. 侯丹.中國林業(yè)科學研究院 2018
[5]植物激素脫落酸的受體蛋白PYL8和PYL9通過結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子MYB家族成員調(diào)控擬南芥的側(cè)根生長[D]. 邢璐.中國科學技術(shù)大學 2016
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[1]擬南芥MYB6調(diào)控莖頂端生長點大小的機制研究[D]. 劉祥政.山東大學 2019
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[5]桑樹MYB轉(zhuǎn)錄因子家族的生物信息學及黃酮合成相關(guān)基因的表達分析[D]. 陳泓宇.西南大學 2015
本文編號:3461447
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