薄皮甜瓜(Cucumis melo L. var. chinensis Pangalo)果皮花斑的遺傳分析及基因定位
發(fā)布時間:2021-10-20 10:43
甜瓜(Cucumis melo L.),屬葫蘆科甜瓜屬(2n=2x=24),是一年生的蔓性草本植物,我國甜瓜的播種面積居世界第一。薄皮甜瓜是中國特色品種,因為具有較好的經濟效益,種植的面積逐年增長。本試驗以薄皮甜瓜(Cucumis melo L.var.chinensis Pangalo)材料IM16559(P1,無斑)、IM16553(P2,有斑)及其配制的F1(正交)、F’1(反交)、F2群體、BC1P1群體和BC1P2群體為材料,將六世代群體田間調查結果和F2群體有斑、無斑DNA混池測序結果相結合,得到薄皮甜瓜果皮花斑基因的初步候選區(qū)間。又擴大群體,通過重組單株的篩選和分子標記的加密進一步縮小區(qū)間,挖掘與基因連鎖的分子標記并進行候選區(qū)間的分析。本試驗的研究結果如下:1.薄皮甜瓜果皮花斑的遺傳分析田間調查發(fā)現,P2、F1(...
【文章來源】:中國農業(yè)科學院北京市
【文章頁數】:53 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
技術路線
士學位論文 第二章 薄皮甜瓜果第二章 薄皮甜瓜果皮花斑的遺傳分析性狀是甜瓜重要的外觀品質之一,目前國內外對于甜瓜果皮花群體進行性狀的遺傳分析在植物中有廣泛的應用,如黃瓜(申,2012)、甘藍(Han et al., 2015)等。本研究采用薄皮甜瓜(C)構建的六世代群體為材料,通過表型的調查和分析來明確果皮礎研究進行了一定的補充。法驗材料是 2 份薄皮甜瓜(Cucumis melo L. var. chinensis Pangal綠色點狀花斑的 IM16553 及其構建的六世代群體。親本及雜交驗材料均由中國農業(yè)科學院蔬菜花卉研究所西甜瓜課題組提供
業(yè)科學院碩士學位論文 第三章 薄皮甜瓜果皮花斑基因 CmSp-1 的 測序數據的質控于測序起點處存在少量 DNA 簇的重疊,分析軟件在對重疊區(qū)進行分析時 5′ 端前誤率相對較高。由于測序過程中化學試劑的消耗,測序錯誤率會隨著序列長度的增而在對堿基測序質量進行分析時,樣品中分布在前 4 個堿基和后十幾個堿基的質量測序堿基。錯誤率分布如圖 3.2 所示,橫坐標為 reads 的堿基位置,縱坐標為單堿151 bp為雙端測序序列的第一端測序reads的錯誤率分布情況,后151 bp為另一端測率分布情況。由圖 3.2 可以看出,測序序列堿基質量分布在前 4 個堿基和后十幾個會低于中間測序堿基,但其質量值都高于 Q30,表明測序序列正確率高于 99.9%,分析。堿基類型分布用于檢測有無 AT、GC 分離現象(圖 3.3),根據堿基互補配對T 和 C 與 G 的含量分別是一致的,圖中橫坐標為 reads 的堿基位置,縱坐標為堿基所色、藍色、紅色、紫色分別代表堿基 G、C、A、T,灰色代表測序中識別不出的堿1 bp 為雙端測序序列的第一端測序 reads 的堿基分布,后 151 bp 為另一端測序 reads結果顯示 AT、CG 堿基基本不發(fā)生分離且曲線較平緩,說明測序結果正常。
本文編號:3446766
【文章來源】:中國農業(yè)科學院北京市
【文章頁數】:53 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
技術路線
士學位論文 第二章 薄皮甜瓜果第二章 薄皮甜瓜果皮花斑的遺傳分析性狀是甜瓜重要的外觀品質之一,目前國內外對于甜瓜果皮花群體進行性狀的遺傳分析在植物中有廣泛的應用,如黃瓜(申,2012)、甘藍(Han et al., 2015)等。本研究采用薄皮甜瓜(C)構建的六世代群體為材料,通過表型的調查和分析來明確果皮礎研究進行了一定的補充。法驗材料是 2 份薄皮甜瓜(Cucumis melo L. var. chinensis Pangal綠色點狀花斑的 IM16553 及其構建的六世代群體。親本及雜交驗材料均由中國農業(yè)科學院蔬菜花卉研究所西甜瓜課題組提供
業(yè)科學院碩士學位論文 第三章 薄皮甜瓜果皮花斑基因 CmSp-1 的 測序數據的質控于測序起點處存在少量 DNA 簇的重疊,分析軟件在對重疊區(qū)進行分析時 5′ 端前誤率相對較高。由于測序過程中化學試劑的消耗,測序錯誤率會隨著序列長度的增而在對堿基測序質量進行分析時,樣品中分布在前 4 個堿基和后十幾個堿基的質量測序堿基。錯誤率分布如圖 3.2 所示,橫坐標為 reads 的堿基位置,縱坐標為單堿151 bp為雙端測序序列的第一端測序reads的錯誤率分布情況,后151 bp為另一端測率分布情況。由圖 3.2 可以看出,測序序列堿基質量分布在前 4 個堿基和后十幾個會低于中間測序堿基,但其質量值都高于 Q30,表明測序序列正確率高于 99.9%,分析。堿基類型分布用于檢測有無 AT、GC 分離現象(圖 3.3),根據堿基互補配對T 和 C 與 G 的含量分別是一致的,圖中橫坐標為 reads 的堿基位置,縱坐標為堿基所色、藍色、紅色、紫色分別代表堿基 G、C、A、T,灰色代表測序中識別不出的堿1 bp 為雙端測序序列的第一端測序 reads 的堿基分布,后 151 bp 為另一端測序 reads結果顯示 AT、CG 堿基基本不發(fā)生分離且曲線較平緩,說明測序結果正常。
本文編號:3446766
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