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基于TCGA數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)NME基因家族生物學功能、在肝癌診斷和預后預測中的應用分析

發(fā)布時間:2021-10-10 19:20
  目的基于TCGA數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)分析腫瘤轉移相關(NME)基因家族(NME 1、2、3、4、5、6、7)生物學功能、相關信號通路,并探討NME基因家族成員對肝癌的診斷、預測預后效能及其與肝癌患者預后的關系。方法從TCGA數(shù)據(jù)庫獲取NME基因家族在肝癌組織和癌旁組織中的表達水平和肝癌患者臨床病理資料。對NME基因進行基因本體論(GO)及KEGG代謝通路分析。比較肝癌組織與癌旁組織中NME基因的表達。應用ROC評價NME基因對肝癌的診斷效能。采用單因素生存分析、Log-rank檢驗和多因素COX生存分析法分析NME基因家族與肝癌患者預后的關系。結果 NME基因主要參與調節(jié)核苷二磷酸激酶活性、細胞凋亡、發(fā)育等生物學過程,主要涉及新陳代謝、抗生素合成、嘌呤和嘧啶代謝途徑等相關通路。肝癌組織中NME1、NME2、NME3、NME6、NME7水平均高于癌旁組織(t分別為8.927、7.044、5.267、8.370、4.349,P均<0.000 1),肝癌組織中NME5水平低于癌旁組織(t=4.306,P <0.000 1),肝癌組織及癌旁組織中NME4水平比較,t=1.403,P=0.16... 

【文章來源】:山東醫(yī)藥. 2020,60(27)

【文章頁數(shù)】:5 頁

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 數(shù)據(jù)獲取
    1.2 NME基因家族的生物功能分析
    1.3 肝癌組織和癌旁組織NME基因的表達觀察
    1.4 NME基因家族對肝癌的診斷效能評價
    1.5 NME基因家族對肝癌預后的預測分析
2 結果
    2.1 NME基因家族的生物學功能及信號通路
    2.2 肝癌組織及癌旁組織中NME基因家族的表達比較
    2.3 NME基因家族對肝癌的診斷效能
    2.4 NME家族基因表達與肝癌患者預后相關性
3 討論


【參考文獻】:
期刊論文
[1]WTX與NME1在結直腸癌組織中的表達變化及其關系探討[J]. 陳文靜,徐家輝,徐陽微,張慶玲.  山東醫(yī)藥. 2016(34)
[2]nm23基因在原發(fā)性乳腺癌組織中的表達及意義[J]. 馬燕飛,浦澗,盧冠銘,陳永誠,覃強,黃劍.  醫(yī)學臨床研究. 2015 (08)
[3]骨髓間質干細胞與腫瘤細胞中FN1、NME2、TIMP3基因表達檢測[J]. 曹維克,許文榮,朱偉,姜潤秋,錢暉.  臨床檢驗雜志. 2006(02)



本文編號:3429001

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