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甘草DNA甲基轉(zhuǎn)移酶基因在高壓靜電場脅迫下的表達(dá)及其系統(tǒng)發(fā)育分析

發(fā)布時間:2021-10-09 23:28
  DNA甲基化是表觀遺傳修飾重要方式之一,參與調(diào)節(jié)植物生長發(fā)育及進(jìn)化等一系列生命過程。DNA甲基化的建立和維持依靠DNA甲基轉(zhuǎn)移酶的參與。本論文以烏拉爾甘草為材料,通過PCR技術(shù)分離到甘草中疑似甲基轉(zhuǎn)移酶基因部分序列,通過相關(guān)生物信息學(xué)分析,得到初步確認(rèn)。構(gòu)建了其與苜蓿、擬南芥等20個物種相關(guān)基因的系統(tǒng)進(jìn)化樹;采用實時熒光定量技術(shù)(RT-qPCR)研究了甘草幼苗中三類甲基轉(zhuǎn)移酶基因經(jīng)過高壓靜電場處理的表達(dá)情況。主要結(jié)果如下:1、采用簡并引物PCR擴(kuò)增的方法,從甘草基因組中分離出了MET1類、DRM類和CMT類甲基轉(zhuǎn)移酶基因片段各一條。MET1類甲基轉(zhuǎn)移酶目的片段長度為951bp,與豌豆MET1基因核酸序列相似性為92.63%;DRM類甲基轉(zhuǎn)移酶目的片段長度為357bp,與苜蓿DRM2基因核酸序列相似性為92.37%;CMT類甲基轉(zhuǎn)移酶目的片段長度為692bp,與苜蓿CMT1基因核酸序列相似性為83.97%。2、采用系統(tǒng)進(jìn)化分析法構(gòu)建了甘草MET1類、DRM類和CMT類甲基轉(zhuǎn)移酶基因和其它20余物種的進(jìn)化樹,甘草的MET1類甲基轉(zhuǎn)移酶和鷹嘴豆距離很近,與DRM類甲基轉(zhuǎn)移酶距離最近的是苜蓿,... 

【文章來源】:內(nèi)蒙古大學(xué)內(nèi)蒙古自治區(qū) 211工程院校

【文章頁數(shù)】:59 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

甘草DNA甲基轉(zhuǎn)移酶基因在高壓靜電場脅迫下的表達(dá)及其系統(tǒng)發(fā)育分析


甘草基因組DNA電泳圖

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內(nèi)蒙古大學(xué)碩士學(xué)位論文13圖2-3以甘草DNA為模板的PCR電泳圖M:2000bpDNAMaker;1:CMT類基因片段擴(kuò)增結(jié)果;2:DRM類基因片段擴(kuò)增結(jié)果;3,4:MET1類基因片段擴(kuò)增結(jié)果Fig.2-3TheelectrophoresisofPCRusinglicoricegenomicDNAasatemplateM:2000bpDNAMaker;1:AmplifiedresultofCMT-like;2:AmplifiedresultofDRM-like;3,4:AmplifiedresultofMET1-like2.3.4基因特異片段序列分析2.3.4.1MET1基因特異片段序列分析測序結(jié)果表明,引物對M1/M2擴(kuò)增片段長度951bp,與預(yù)期大小一致。進(jìn)入NCBI進(jìn)行BLAST,結(jié)果顯示,引物對M1/M2擴(kuò)增出的951bp片段Gu-M1與豌豆MET1基因(AF034419)的核酸序列相似性為92.63%,E-value:3e-177;氨基酸序列相似性為96.08%,E-value:5e-30?纱_認(rèn)Gu-M1為甘草MET1基因特異性片段。

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內(nèi)蒙古大學(xué)碩士學(xué)位論文14圖2-4MET1類基因片段核酸序列與豌豆序列在BLAST中比對Query:所測甘草序列;Subject:豌豆序列AlignmentScores>=20080-200Figure2-4MET1genefragmentnucleicacidsequenceandpeasequencealignmentinBLASTQuery:measuredlicoricesequence;Subject:peasequenceAlignmentScores>=20080-200

【參考文獻(xiàn)】:
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碩士論文
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[6]優(yōu)質(zhì)甘草組培快繁及遺傳穩(wěn)定性分析[D]. 蘇姍.河北科技大學(xué) 2015
[7]茶樹冷馴化過程中DNA甲基化的變化分析及DNA甲基轉(zhuǎn)移酶基因CsDRM2的克隆[D]. 周艷華.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2015
[8]馬鈴薯甲基轉(zhuǎn)移酶和去甲基化酶預(yù)測及表達(dá)研究[D]. 毛銳濤.內(nèi)蒙古大學(xué) 2014
[9]高壓靜電場對羽衣甘藍(lán)種子萌發(fā)過程DNA甲基化的影響[D]. 李娜.東北林業(yè)大學(xué) 2013
[10]非生物脅迫下SIBADH基因在遼寧堿蓬和轉(zhuǎn)pB-BADH煙草中的表達(dá)特性分析[D]. 張寅寅.遼寧師范大學(xué) 2013



本文編號:3427193

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