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利用酵母雙雜交技術篩選與馬鈴薯StNAC262互作的功能基因

發(fā)布時間:2021-09-29 23:49
  NAC命名來源于矮牽牛(Petunia hybrida)NO APICAL MERISTEM(NAM)基因和擬南芥(Arabidopsis thaliana)ATAF1/ATAF2基因和CUP-SHAPED COTYLEDON2(CUC2)基因。NAC蛋白質是植物特異性轉錄因子(Transcription factors,TF)最大家族組成之一,大多數(shù)NAC TF在植物發(fā)育和應激反應中起著重要作用。研究發(fā)現(xiàn)在轉基因植物中過表達時,許多非生物脅迫上調的NAC蛋白可促進根生長或改變根結構,表明NAC基因在滲透脅迫下有調節(jié)根生長和改變根結構的作用。這些發(fā)現(xiàn)有助于解析由NAC蛋白控制的信號傳導和轉錄重編程的復雜機制。但有關NAC轉錄因子靶基因的知識仍然有限。因此,本研究利用與NAC的功能蛋白相互作用的宿主因子為突破口,利用酵母雙雜交技術篩選與之互作的宿主因子,以期研究NAC基因對馬鈴薯干旱脅迫響應的影響,更好的了解NAC的生物學特性、抗旱機制,從而為進一步研究NAC基因在馬鈴薯干旱脅迫中的作用提供一定的理論基礎。取得的主要研究結果如下:1.StNAC262的生物信息學分析預測表明,St NAC... 

【文章來源】:甘肅農業(yè)大學甘肅省

【文章頁數(shù)】:65 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

利用酵母雙雜交技術篩選與馬鈴薯StNAC262互作的功能基因


NAC蛋白的結構和調控Fig.1.1StructureandregulationofNACproteins

模型圖,調控表達,模型


氣孔保衛(wèi)細胞中表達,在不影響光合速率的前提下使氣孔關閉,這使得植株性大大提高,也不會影響產量[32]。SNAC2 在水稻中可以抗旱、抗鹽、抗冷械損傷和 ABA,且不會影響萌發(fā)率和生長率。受高鹽和 ABA 脅迫誘導的AC1 為海茄冬 NAC 蛋白與番茄和馬鈴薯中 NAC 高度同源;ㄉ械腁C2/3 與擬南芥 RD26 同源,它們都受 ABA、GA3、低溫的誘導表達。SINACINAM1 是在番茄中發(fā)現(xiàn)的的鹽敏感 NAC 基因,主要在花和成熟果實中表達萄中發(fā)現(xiàn)的 VpNAC1 是 NAC 轉錄因子,可以提高對白粉病菌和煙草黑脛病抵抗能力。已發(fā)現(xiàn)的 NAC 基因大多對生物脅迫和非生物脅迫都有響應,擬在鹽溶液處理下,僅在根中就發(fā)現(xiàn)了 33 個 NAC 基因受到影響[59],功能明只占很少一部分,大多數(shù)基因研究尚處于基因克隆、結構鑒定和表達分析層,在不同的植物中分離鑒定 NAC 尤其重要。因此我們認為 NAC 在病害生逆境發(fā)揮著重要作用如圖 2.1[21]。

分子進化樹,馬鈴薯,擬南芥,氨基酸序列


甘肅農業(yè)大學 2018 屆碩士學位論文3 結果與分析3.1 StNAC 的生物信息學分析.1.1 馬鈴薯 StNAC262 基因進化分析用軟件 CluxtalX1.8 和 MEGA 5.0 程序對所有 StNAC 和 AtNAC TFs 進行序列比對,使用鄰接法,用多序列比對文件構建無根系統(tǒng)發(fā)育樹(如圖 2.果表明目標基因屬于馬鈴薯 NAC 轉錄因子的 NAM 亞家族。StNAC 和 AtN度保守,具有高度相似的基因結構。利用在線軟件 NCBI 分析發(fā)現(xiàn) StNAC有兩個保守區(qū)(如圖 2.2)。為了進一步了解其進化關系,用軟件 CluxtalX1.AC262 基因以及煙草屬的 NAC100-like 基因、番茄 NAC100 基因進行蛋白多序列比對,結果顯示盡管這些基因存在結構上的差異,但是仍然具有一個的 NAC DNA-binding 結構域。

【參考文獻】:
期刊論文
[1]植物種子發(fā)育相關NAC家族轉錄因子研究進展[J]. 黃娟,鄧嬌,朱麗偉,陳慶富.  種子. 2017(11)
[2]蛋白質亞細胞定位預測研究進展[J]. 鄭珊珊,石卓興,代琦,姚玉華.  科技視界. 2014(15)
[3]植物NAC轉錄因子的研究進展[J]. 康桂娟,曾日中,聶智毅,黎瑜,代龍軍,段翠芳.  生物技術通報. 2012(11)
[4]植物NAC轉錄因子的種類、特征及功能[J]. 李偉,韓蕾,錢永強,孫振元.  應用與環(huán)境生物學報. 2011(04)
[5]植物蛋白質的亞細胞定位研究進展[J]. 邢浩然,劉麗娟,劉國振.  華北農學報. 2006(S2)
[6]馬鈴薯不同品系貯藏期品質分析[J]. 田豐,張永成,師理,孫海林,阮建平,納添倉.  中國馬鈴薯. 2006(01)
[7]Predicting Protein Subcellular Localization: Past, Present, and Future[J]. Pierre Dnnes,Annette Hglund.  Genomics Proteomics & Bioinformatics. 2004(04)

碩士論文
[1]基于多標記學習的蛋白質亞細胞定位預測[D]. 趙青.濟南大學 2016
[2]馬鈴薯miRNA164及其靶基因功能研究[D]. 姚磊.甘肅農業(yè)大學 2016



本文編號:3414693

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