青海湖裸鯉AP-1基因的克隆與表達分析
發(fā)布時間:2021-09-06 22:00
AP-1是細胞增殖和分化的重要轉錄因子,在動物免疫、發(fā)育等方面發(fā)揮著重要作用。本研究采用RACE方法克隆了青海湖裸鯉AP-1基因的c DNA全長序列,通過實時熒光定量PCR探究了其在不同組織中的表達情況。結果顯示,青海湖裸鯉AP-1的cDNA序列全長為1 832 bp,CDS區(qū)918 bp,共編碼305個氨基酸,預測該蛋白的分子量為33.69 kD,等電點9.20。系統(tǒng)進化結果顯示青海湖裸鯉與犀角金線鲃有較高的同源性。蛋白結構預測顯示該基因編碼的蛋白C端具有一個典型的堿性區(qū)和一個高度保守的亮氨酸拉鏈結構,該結構能與DNA相結合。qRT-PCR結果表明,AP-1基因在肌肉、肝臟、鰓、心、腎、腦、腸和脾臟中均有表達。在肌肉中具有最高表達量(p<0.01),其次為肝臟和鰓(p<0.01),在脾臟中表達量最低。本研究為進一步了解青海湖裸鯉AP-1基因的功能提供了數據基礎。
【文章來源】:基因組學與應用生物學. 2020,39(07)北大核心CSCD
【文章頁數】:8 頁
【部分圖文】:
AP-1蛋白的三級結構
實時定量PCR結果顯示,該基因在肌肉、肝臟、鰓、心、腦、腸、腎和脾臟中都有表達,表達具有普遍性。吳冰等(2014)在對凡納濱對蝦進行研究時,得出結論AP-1表達于多種組織中,不存在組織表達的特異性,且具有普遍的表達性。但在不同的組織中其表達量不同,在肌肉中表達量最高,脾臟中表達量最低。Baresic等(2014)研究表明,AP-1含有的JUN和ATF蛋白復合物在肌肉細胞中的表達量是最高的,激活蛋白1復合物(AP-1)在肌肉中的高表達對于過氧化物酶體增殖激活受體輔激活因子1 (PGC-1)調控缺氧反應基因起到重要作用,AP-1與PGC-1的相互作用對缺氧反應起到協(xié)同作用,該基因缺失會降低PGC-1對靶基因的正向調控能力。因此,表明AP-1基因在肌肉中表達量較高,這與本實驗得出的AP-1基因在肌肉中的表達量是最高的結論一致。也有研究表明,AP-1基因在青蛤5個組織中的表達時,得出在閉殼肌中該基因的表達量排第二,是比較高的,與本實驗結果也有相似之處(丁丹等,2018)。Zoysa等(2010)在研究鮑魚免疫相關基因的表達時,檢測出AP-1在肌肉和鰓中有高表達量,這與本實驗結果相一致。AP-1是與免疫相關的基因,本研究中AP-1基因在鰓中的表達量比較高,而在脾臟中的表達量相對較低。因此,推測AP-1在青海湖裸鯉中可能只參與了部分免疫過程。圖5 基于青海湖裸鯉AP-1氨基酸序列的系統(tǒng)進化樹
基于青海湖裸鯉AP-1氨基酸序列的系統(tǒng)進化樹
【參考文獻】:
期刊論文
[1]《轉錄因子JunB/AP-1調節(jié)多發(fā)性骨髓瘤在骨髓微環(huán)境中的細胞增殖與耐藥》解讀[J]. 范鳳娟,江沁月,孫春艷,胡豫. 臨床血液學雜志. 2018(04)
[2]中華蜜蜂轉錄因子AP-1基因的克隆及特性分析[J]. 郗學鵬,魏偉,張衛(wèi)星,王紅芳,胥保華. 昆蟲學報. 2018(04)
[3]青蛤(Cyclina sinensis)AP-1基因的克隆及在鰻弧菌(Vibrio anguillarum)侵染下的表達分析[J]. 丁丹,潘寶平,王玉梅,侯梓園,閆春財. 海洋與湖沼. 2018(01)
[4]AP-1的研究進展[J]. 伍培,趙建美. 南通大學學報(醫(yī)學版). 2018(01)
[5]凡納濱對蝦AP-1基因的克隆和表達特征分析[J]. 吳冰,劉逸塵,張亦陳,耿緒云,孫金生. 水產學報. 2014(09)
[6]青海湖裸鯉與花斑裸鯉肌肉理化特性比較[J]. 孫萬成,申志新,羅毅皓,王國杰. 食品研究與開發(fā). 2013(14)
本文編號:3388250
【文章來源】:基因組學與應用生物學. 2020,39(07)北大核心CSCD
【文章頁數】:8 頁
【部分圖文】:
AP-1蛋白的三級結構
實時定量PCR結果顯示,該基因在肌肉、肝臟、鰓、心、腦、腸、腎和脾臟中都有表達,表達具有普遍性。吳冰等(2014)在對凡納濱對蝦進行研究時,得出結論AP-1表達于多種組織中,不存在組織表達的特異性,且具有普遍的表達性。但在不同的組織中其表達量不同,在肌肉中表達量最高,脾臟中表達量最低。Baresic等(2014)研究表明,AP-1含有的JUN和ATF蛋白復合物在肌肉細胞中的表達量是最高的,激活蛋白1復合物(AP-1)在肌肉中的高表達對于過氧化物酶體增殖激活受體輔激活因子1 (PGC-1)調控缺氧反應基因起到重要作用,AP-1與PGC-1的相互作用對缺氧反應起到協(xié)同作用,該基因缺失會降低PGC-1對靶基因的正向調控能力。因此,表明AP-1基因在肌肉中表達量較高,這與本實驗得出的AP-1基因在肌肉中的表達量是最高的結論一致。也有研究表明,AP-1基因在青蛤5個組織中的表達時,得出在閉殼肌中該基因的表達量排第二,是比較高的,與本實驗結果也有相似之處(丁丹等,2018)。Zoysa等(2010)在研究鮑魚免疫相關基因的表達時,檢測出AP-1在肌肉和鰓中有高表達量,這與本實驗結果相一致。AP-1是與免疫相關的基因,本研究中AP-1基因在鰓中的表達量比較高,而在脾臟中的表達量相對較低。因此,推測AP-1在青海湖裸鯉中可能只參與了部分免疫過程。圖5 基于青海湖裸鯉AP-1氨基酸序列的系統(tǒng)進化樹
基于青海湖裸鯉AP-1氨基酸序列的系統(tǒng)進化樹
【參考文獻】:
期刊論文
[1]《轉錄因子JunB/AP-1調節(jié)多發(fā)性骨髓瘤在骨髓微環(huán)境中的細胞增殖與耐藥》解讀[J]. 范鳳娟,江沁月,孫春艷,胡豫. 臨床血液學雜志. 2018(04)
[2]中華蜜蜂轉錄因子AP-1基因的克隆及特性分析[J]. 郗學鵬,魏偉,張衛(wèi)星,王紅芳,胥保華. 昆蟲學報. 2018(04)
[3]青蛤(Cyclina sinensis)AP-1基因的克隆及在鰻弧菌(Vibrio anguillarum)侵染下的表達分析[J]. 丁丹,潘寶平,王玉梅,侯梓園,閆春財. 海洋與湖沼. 2018(01)
[4]AP-1的研究進展[J]. 伍培,趙建美. 南通大學學報(醫(yī)學版). 2018(01)
[5]凡納濱對蝦AP-1基因的克隆和表達特征分析[J]. 吳冰,劉逸塵,張亦陳,耿緒云,孫金生. 水產學報. 2014(09)
[6]青海湖裸鯉與花斑裸鯉肌肉理化特性比較[J]. 孫萬成,申志新,羅毅皓,王國杰. 食品研究與開發(fā). 2013(14)
本文編號:3388250
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